Als de fermentatie goed verloopt zal Bokashi een zeer lage tot geen onkruiddruk geven. Dit is vooral duidelijk bij organische resten die in een Bokashi hoop worden gefermenteerd. Oliehoudende zaden zullen wat meer vocht en tijd nodig hebben. Dus de hoop wat natter en langer laten zitten. Bij Bokashi voeg je de effectieve micro-organismen (EM) toe. Een brede waaier van stammen die de fermentatie starten. Zout is niet nodig om ongewenste bacteriën en schimmels te weren. Daar zorgt EM voor.