А.Н.Русакович "Секвенирование по Сенгеру..."/A.N.Rusakovich ”Sanger sequencing...”

  Рет қаралды 3,874

dlnp.jinr

dlnp.jinr

Күн бұрын

Пікірлер: 11
@rudova_katerina
@rudova_katerina 3 ай бұрын
было полезно, спасибо
@Piratka521
@Piratka521 Жыл бұрын
спасибо за объяснение секвенирования по Сэнгеру. Среди многих видео объяснений поняла только ваше
@Helga_Li
@Helga_Li 11 ай бұрын
Спасибо огромное! Наконец-то я поняла суть этого процесса ❤️
@alisarivera7373
@alisarivera7373 Жыл бұрын
спасибо за лекцию, вопросы которые задавались очень точные. спасибо
@ЭлизаФайзуллина
@ЭлизаФайзуллина 4 жыл бұрын
Круто, спасибо за объяснение про механизм секвенирования и ответы на вопросы, я всё поняла
@altynayumurbekova
@altynayumurbekova 2 жыл бұрын
спасибо за лекцию!
@SuperTurg
@SuperTurg 3 жыл бұрын
Остался вопрос по праймерам - как можно заказать праймер, если последовательность оснований может быть не известна, а известна только длина? разве можно заранее знать последовательность оснований, особенно если речь идёт о длине в 100-800 оснований? И если известен праймер - то по нему и так понятна последовательность изучаемого участка ДНК. И тут же следующий вопрос - а если нужно читать 8000 последовательностей, это нужно иметь 8 затравок по 800, как потом по завершению понять, как сшить данные 8 прогонов? Спасибо.
@dlnpjinr
@dlnpjinr 3 жыл бұрын
Отвечает Артем Русакович: Исследования бывают разного формата. Иногда исследуется что то совсем большое а иногда что то относительно маленькое. Что я имею ввиду... Можно найти в джунглях новый вид паука и (условно) считать что мы ничего не знаем о его ДНК. И тогда это будет формат исследований связанный с полногеномным секвенированием de novo (на человеческий - читаем ДНК вслепую). И в таком случае будет много своих нюансов. Секвенирование по Сенгеру о котором я тогда рассказывал это не то чтоб не связано с этим. Это в другую степь. Вопросы того как исследовать ДНК "непойми с какого места" решаемы но это отдельная большая история. Если же перейти обратно к сенгеру и вопросу "а зачем собственно секвенировать то что мы и так знаем, ведь праймер известен?"... Да праймер действительно дизайнится на основании известных данных о ДНК, но праймер довольно короткий (примерно) 20 оснований. Участок в допустим 1000 оснований должен иметь только два места для праймеров (1000 - 20 - 20 = 960) что оставляет довольно много места для неизвестного. Но бывает и еще более непонятно. Вот например дрозофила (которую исследуют в моей группе). Генетически изучена вдоль и поперек (по крайней мере на уровне последовательности днк), однако существует такая вещь как мутации. Была муха - облучили - народились мушата без крыльев - мутация. Генетический материал при таком событии изменяется и становится "частично-неизвестным". Мы знаем что из себя представляет условный ген крыла (на самом деле их много) и какая у него последовательность, но мутация сделала кусочек неизвестным. Это может быть изменение вплоть до 1 основания (что при возможной длинне гена в например 10 000 оснований становится жалкой долей процента) но где это основание и что с ним не так мы не можем сказать не изучая ДНК. Таким образом мы используем праймеры которые предположительно находятся где то с права и слева от места изменения, ставим ПЦР, секвенируем, узнаем что там было. В случае на счет протяженных участков для исследования... Используется несколько пар праймеров выбранных в соответствии с набором факторов. Факторы в текущем контексте значения не имеют, но вот пары праймеров да. Чем больше участок тем больше пар праймеров потребуется. Чтобы собрать "цельный" кусок потом праймеры заранее планируют так чтобы между отрезками днк которые они покрывают были перекрытия. Таким образом конец одного участка будет идентичен началу следующего и на этом основании можно делать вывод об общей картине
@SuperTurg
@SuperTurg 3 жыл бұрын
@@dlnpjinr Спасибо за ответ, теперь всё встало на свои места
@antonl7652
@antonl7652 2 жыл бұрын
Лектор нифига не умеет объяснять, достаточно аросто чказать что берется половина днк, праймеры, обычные нуклеотиды и нуклеотиды измененные, которые светятся разными цветами и которые останавливают репликацию. Все это замешивается, в результате получается много фрагментов разной длины, среди которых много отрезков с одинаковой длиной, далее надо их выстроить как пионеров по росту и посмотреть свечение каждой фракции.
@СергейЧеркез-в2ч
@СергейЧеркез-в2ч Жыл бұрын
Для чего секвенировать дконкретный участок гена? Если продукт или признак шинкуется в процессе сплайсинга, в конечном итоге?
I Sent a Subscriber to Disneyland
0:27
MrBeast
Рет қаралды 104 МЛН
«Жат бауыр» телехикаясы І 26-бөлім
52:18
Qazaqstan TV / Қазақстан Ұлттық Арнасы
Рет қаралды 434 М.
I Sent a Subscriber to Disneyland
0:27
MrBeast
Рет қаралды 104 МЛН