Difference between FASTA and FASTQ file formats. How to make a fasta formatted file.

  Рет қаралды 14,463

XploreBio

XploreBio

Күн бұрын

Пікірлер
@kuldipjayaswall7924
@kuldipjayaswall7924 3 жыл бұрын
Videos are very informative sir pl keep updating all of us with these information
@XploreBio
@XploreBio 3 жыл бұрын
Surely.. Thanks
@pushpalathamanjunatha7810
@pushpalathamanjunatha7810 2 жыл бұрын
excellent, slowing down the lecture will be highly beneficial
@russellguo7572
@russellguo7572 4 ай бұрын
this is amazing! thank you so much!very organized and clear
@XploreBio
@XploreBio 4 ай бұрын
Thanks :)
@tulikabhardwaj484
@tulikabhardwaj484 3 жыл бұрын
Thank you so much for such an informative video.
@akanshasingh5213
@akanshasingh5213 2 жыл бұрын
Can you please upload more videos regarding NGS. It’s a very good explanation between these two file formats
@stephanie_4203
@stephanie_4203 2 жыл бұрын
I luv your channnel. Thanks for exists
@XploreBio
@XploreBio 2 жыл бұрын
I am glad you like them!
@prasanthchigurupatii
@prasanthchigurupatii 3 жыл бұрын
Hi sir Your videos and the way u r representation is awsome superbbb
@XploreBio
@XploreBio 3 жыл бұрын
@Prasanth..Thanks..
@michellew4634
@michellew4634 2 жыл бұрын
so helpful thanks for making this!
@vinoann1165
@vinoann1165 3 жыл бұрын
Expecting more videos under bioinformatics topic sir.
@tiberiusmogendigisemba5395
@tiberiusmogendigisemba5395 2 жыл бұрын
Thanks 🙏🙏
@muni-88
@muni-88 9 ай бұрын
can i get fastq file on ncbi database or can i convert fasta ti fastq i need to run macrel, a antimicrobial peptide prediction pipeline from whole genome for my phd. can u plz help
@XploreBio
@XploreBio 4 ай бұрын
You can get .fastq file from NCBI's SRA, ENA, or DDBJ. Or if you have got it sequenced you will get it from sequencing facility. Fasta file does not carry quality information therefore you cannot convert it to fastq.
@chemobioseditorialakhilesh5403
@chemobioseditorialakhilesh5403 3 жыл бұрын
Sir, I am writing research article there is a used of different software like VMir, MFold , Mature Bayes , miRBD , cytoscape , clueGO, CluePedia ,CytoKEGG, Reactome , MCODE etc.. Can help me how we use these software...
@XploreBio
@XploreBio 3 жыл бұрын
Please write to me @ xplorebio@yahoo.com
@abrhamulu9610
@abrhamulu9610 3 жыл бұрын
Dear Sir, Can I submit my sequence data to NCBI in FASTq Format? if no, How can I change my FASTq data to FASTA format?
@XploreBio
@XploreBio 3 жыл бұрын
What kind of data you want to submit? Large data is submitted as fastq. gene or protein sequence as fasta. there are tools for converting fastq to fasta.
@XploreBio
@XploreBio 3 жыл бұрын
This might help. www.biostars.org/p/85929/
@abrhamulu9610
@abrhamulu9610 3 жыл бұрын
@@XploreBio thank you Sir, I have 16S rRNA sequence data (fastq format) from metagenomic DNA of four environmental samples, each samples containing 600 to 1000 spp. of bacteria.
@abrhamulu9610
@abrhamulu9610 3 жыл бұрын
@@XploreBio thank you, Sir!
@ebenezeroladimeji599
@ebenezeroladimeji599 3 жыл бұрын
hello XploreBio. I love your classes. however, I am currently working on a paper that has something to do with RNA-seq data. I would love if you could be of help in anyway.. Thanks.
@XploreBio
@XploreBio 3 жыл бұрын
Hi. thanks Ebenezer what kind of help do you need.
@ebenezeroladimeji599
@ebenezeroladimeji599 3 жыл бұрын
@@XploreBio may I have your email for proper information or anyway to communicate outside youtube...
@XploreBio
@XploreBio 3 жыл бұрын
Write to me @ xplorebio@yahoo.com
@prasanthchigurupatii
@prasanthchigurupatii 3 жыл бұрын
Sir , Please make us understand about Transcriptomics data representation plots.
@Devil_ill-777.
@Devil_ill-777. 11 күн бұрын
Hi
Understanding SAM/BAM file specifications
18:20
LiquidBrain Bioinformatics
Рет қаралды 20 М.
Сестра обхитрила!
00:17
Victoria Portfolio
Рет қаралды 958 М.
Quando A Diferença De Altura É Muito Grande 😲😂
00:12
Mari Maria
Рет қаралды 45 МЛН
We Attempted The Impossible 😱
00:54
Topper Guild
Рет қаралды 56 МЛН
VIP ACCESS
00:47
Natan por Aí
Рет қаралды 30 МЛН
Understanding Bioinformatics File Formats: GFF3 and GTF
12:01
Bioinformagician
Рет қаралды 8 М.
5 genomics file formats you must know
19:10
OMGenomics
Рет қаралды 26 М.
What are reads, contigs and scaffold?
3:48
XploreBio
Рет қаралды 39 М.
Sequence file formats | Ms Mercy Rophina
24:38
Genomics In India
Рет қаралды 1,5 М.
Importing and demultiplexing
16:23
QIIME 2
Рет қаралды 15 М.
Bioinformatics part 4 Introduction to FASTA and BLAST
14:25
Shomu's Biology
Рет қаралды 240 М.
Covariance, Clearly Explained!!!
22:23
StatQuest with Josh Starmer
Рет қаралды 573 М.
STAT115 Chapter 3.2 FASTQ and FASTQC
13:13
Xiaole Shirley Liu
Рет қаралды 17 М.
Сестра обхитрила!
00:17
Victoria Portfolio
Рет қаралды 958 М.