Bedanya kalo di mesjid gede kesultanan Yogyakarta area sholat khusus Sultan berada paling depan samping mimbar agung, karena filosofi dan fungsi serta tugas Sultan sebagai khalifatullah Jawa, dan panatagama (pemimpin agama rakyat Jawa). Kemudian di shaff blkangnya abdidalem kaji dan suranatan yg terdiri dari para kyai dan ulama.