How to generate a Ramachandran plot using PyMol (extension DynoPlot)

  Рет қаралды 7,716

Shayon Bhattacharya

Shayon Bhattacharya

Күн бұрын

Пікірлер: 13
@hitkarshkushwaha2434
@hitkarshkushwaha2434 2 жыл бұрын
Great job sir
@estertshipamba989
@estertshipamba989 3 жыл бұрын
Hi great tutorial!
@giridharanlm4349
@giridharanlm4349 3 жыл бұрын
great lecture !
@rahel5613
@rahel5613 3 жыл бұрын
I installed the Dynoplot but the command didn't work for me. any suggestions?
@bikidas2718
@bikidas2718 3 ай бұрын
how can i get the link to download dynoplot
@castilloh.gianmarco1048
@castilloh.gianmarco1048 2 жыл бұрын
Good afternoon, could you send me the link you put in the url, please.
@dnadatadive
@dnadatadive 4 жыл бұрын
please provide the link of Dynoplot from where we can download
@shayonbh_molmod
@shayonbh_molmod 4 жыл бұрын
sure, please see link pymolwiki.org/index.php/DynoPlot ...instructions to install the PyMol plugin is given in the video.
@dnadatadive
@dnadatadive 4 жыл бұрын
@@shayonbh_molmod thanks but is their anyway I can get the same results like I used to get from RAMPAGE tool. I mean the residues in favourable and outlier region that kind of information. It is only giving the plot.
@pratibhapatil2089
@pratibhapatil2089 3 жыл бұрын
What is your profession?
@shayonbh_molmod
@shayonbh_molmod 3 жыл бұрын
jobless...
@cheninitayeb6590
@cheninitayeb6590 3 жыл бұрын
please links of url as you pasted Sir thank you in advance
@shayonbh_molmod
@shayonbh_molmod 2 жыл бұрын
pymolwiki.org/index.php/DynoPlot
How to predict protein dynamics from temperature factor using VMD?
18:39
Shayon Bhattacharya
Рет қаралды 1,2 М.
Building missing residues in PDB structure as loop regions using PyMol
29:58
Shayon Bhattacharya
Рет қаралды 14 М.
World’s strongest WOMAN vs regular GIRLS
00:56
A4
Рет қаралды 6 МЛН
Elza love to eat chiken🍗⚡ #dog #pets
00:17
ElzaDog
Рет қаралды 13 МЛН
Человек паук уже не тот
00:32
Miracle
Рет қаралды 2,4 МЛН
Seja Gentil com os Pequenos Animais 😿
00:20
Los Wagners
Рет қаралды 67 МЛН
Homology modelling using SWISS-MODEL web server
26:53
Shayon Bhattacharya
Рет қаралды 22 М.
Protein-ligand docking with AutoDock Vina and UCSF Chimera
35:28
Shayon Bhattacharya
Рет қаралды 24 М.
How to generate a Ramachandran plot using PyMol extension DynoPlot
21:55
Bernal Institute
Рет қаралды 1,3 М.
Ramachandran Principle: Protein Atomic Clashes vs. Phi & Psi
8:50
How to Interpret Ramachandran Plots
8:32
Catalyst University
Рет қаралды 76 М.
Beginners guide to protein modelling
37:03
Maureen Quin
Рет қаралды 54 М.
PyMOL Quickie - Making Mutations
31:35
PyMOL Ross
Рет қаралды 4,1 М.
Protein Visualization Tool | PyMOL Tutorial for Beginners
14:16
Sanket Bapat
Рет қаралды 50 М.
Protein structure prediction by Threading: I-TASSER web server
22:04
Shayon Bhattacharya
Рет қаралды 2,4 М.
World’s strongest WOMAN vs regular GIRLS
00:56
A4
Рет қаралды 6 МЛН