How to validate docking and display findings for 2D-QSAR: prepare, dock, and re-dock in detail

[@duc-hainguyen8499]

Link to download: 1) AutoDock 4.2.6 / AutoDockTools 1.5.6 - Suite of Automated Docking Tools Link: mybiosoftware.com/autodock-4-2-3-autodocktools-1-5-6-suite-automated-docking-tools.html 2) AutoDock Vina Link: vina.scripps.edu/downloads/ 3) Avogadro Link: avogadro.cc/ 4) MOE Link: drive.google.com/file/d/1X1c7l-U6yCGcsIElnzDPRw8nUMhsgioM/view 5) Discovery Studio Link: discover.3ds.com/discovery-studio-visualizer-download

[@AnhthuDIY]

Tuyệt vời 🎉cảm ơn bạn đã chia sẻ 🎉

[@duc-hainguyen8499]

cam on ban rat nhieu nhe

[@haha-rs4un]

video rất hữu ích

[@duc-hainguyen8499]

cam on ban rat nhieu

[@Hainguyen-ow7vh]

Thanks for sharing the best information on QSAR study

[@duc-hainguyen8499]

many thanks

[@nhacchill2223]

Tuyệt quá.bạn chia sẻ rất hay. Thank you for making a nice video

[@duc-hainguyen8499]

cam on ban rat nhieu nhe

[@trannguyen1993s]

Kiến thức thú vị quá. cảm ơn bạn đã chia sẽ cho mọi người cùng học hỏi

[@duc-hainguyen8499]

cam on ban rat nhieu nhe

[@bichle059]

Kiến thức thú vị quá. cảm ơn bạn đã chia sẻ

[@duc-hainguyen8499]

Cam on ban nhe

[@animalssoundsonline]

Thank you for making a nice video

[@duc-hainguyen8499]

So nice of you

[@vietvo8744]

cám ơn b đã chia sẻ!

[@duc-hainguyen8499]

cam on ban rat nhieu nhe

[@munvlog4781]

Tuyệt vời bạn chia sẻ rất hay và thú vị

[@duc-hainguyen8499]

Cam on ban nhe

[@KyUcDaXa]

Tuyệt quá.bạn chia sẻ rất hay

[@duc-hainguyen8499]

cam on ban rat nhieu nhe

[@henrynguyen2051]

What a great video!!!!!!!!!!!1

[@duc-hainguyen8499]

many thanks

[@HanLe-hd1yy]

good job.

[@duc-hainguyen8499]

Thank you! Cheers!

[@2acc-e1n]

amazing

[@duc-hainguyen8499]

cam on ban rat nhieu

[@HueNguyen-vr7ts]

Very good knowledge, beautiful images, thank you very much channel owner

[@duc-hainguyen8499]

Thanks to you

[@tanlongland]

Tuyệt quá.bạn chia sẻ rất hay, thank bạn!

[@duc-hainguyen8499]

cam on ban nhe

[@ThịHuyềnNhưNguyễn-p4w]

Best information bim

[@duc-hainguyen8499]

So nice of you

[@gamelienquan19]

Video rất hay cám ơn b đã chia sẻ

[@duc-hainguyen8499]

cam on ban rat nhieu nhe

[@nguyenthituongduyofficial]

Hay quá, rất nhiều kiến thức bổ ích

[@duc-hainguyen8499]

cam on ban rat nhieu nhe

[@duc-hainguyen8499]

**Data and code available here: (1) AutoDock 4.2.6 / AutoDockTools 1.5.6 - Suite of Automated Docking Tools Link: mybiosoftware.com/autodock-4-2-3-autodocktools-1-5-6-suite-automated-docking-tools.html (2) AutoDock Vina Link: vina.scripps.edu/downloads/ (3) Avogadro Link: avogadro.cc/ (4) MOE Link: drive.google.com/file/d/1X1c7l-U6yCGcsIElnzDPRw8nUMhsgioM/view (5) Discovery Studio Link: discover.3ds.com/discovery-studio-visualizer-download (6) github.com/herrynguyen1706/Selecting-the-best-molecular-descriptor (7) Detail explain here: doi.org/10.1016/j.compbiolchem.2023.107872

[@BongKids9M]

Thank you for creating a great video

[@duc-hainguyen8499]

Thank you too

[@kenhgiaitri7349]

Rất bổ ích. Cám ơn bạn chia sẻ

[@duc-hainguyen8499]

cam on ban rat nhieu nhe

[@tungphung6650]

Good

[@duc-hainguyen8499]

So nice

[@NgọcNgọc-p6u]

I learned a lot from this video. I can perform docking by myself now.

[@duc-hainguyen8499]

Great. Hope it will help.

[@2acc-e1n]

amazing bro

[@duc-hainguyen8499]

thanks

[@tuonvg9831]

Nice

[@duc-hainguyen8499]

So nice

[@MyTran-r6x]

It helps me a lot. Please make more videos.

[@duc-hainguyen8499]

many thanks

[@thien7564]

Kiến thức hay

[@duc-hainguyen8499]

cám ơn bạn nhe

[@dungnguyen.giaitri]

Thanks for your sharing.❤❤

[@duc-hainguyen8499]

You are so welcome

[@Hana-kw8uw]

video hay lắm

[@duc-hainguyen8499]

cam on ban rat nhieu

[@TuanNguyen-nz4jv]

cảm ơn b đã chia sẻ rất hữu ích❤

[@duc-hainguyen8499]

cam on ban nhe

[@quynhphan5799]

chia sẻ rất hay, cảm ơn b nhiều nha

[@duc-hainguyen8499]

cam on ban rat nhieu nhe

[@LeTuan-nc3kc]

Kiến thức chia sẽ rất hữu ích ạ

[@duc-hainguyen8499]

Cam on ban nhe

[@LiệuNguyễn-h9g]

Bổ ích quá ạ, cảm ơn bạn đã chia sẻ

[@duc-hainguyen8499]

cam on ban rat nhieu nhe

[@MedicĐôngNamXétnghiệm]

thank you for sharing some helpful information

[@duc-hainguyen8499]

Glad it was helpful!

[@MinhNguyen-t9i7z]

What a great video!!!!!!!!!!!

[@duc-hainguyen8499]

Glad you liked it!

[@bboypop71]

Chia sẻ hay lắm bạn

[@duc-hainguyen8499]

cam on ban rat nhieu nhe

[@TrinhHuy472]

Kiến thức thú vị quá. cảm ơn bạn đã chia sẽ cho mọi người cùng học hỏi

[@duc-hainguyen8499]

cam on ban rat nhieu nhe

[@KhaiNguyen-c9u]

Thật hữu ích

[@duc-hainguyen8499]

cam on ban nhe

[@Funny.anime31]

useful and healthy video 👍

[@duc-hainguyen8499]

cam on ban rat nhieu

[@suriamarlinamansor175]

thank you so much Dr. very informative and well explain😍

[@duc-hainguyen8499]

Many thanks. I hope it will help

[@kallyvolleyball]

very useful, thank you

[@duc-hainguyen8499]

many thanks

[@musicvslife]

Kiến thức rất hữu ích cho người dùng

[@duc-hainguyen8499]

cam on ban rat nhieu nhe

[@Quangquang11223]

good

[@duc-hainguyen8499]

Thanks

[@NguyễnTuấn-k1g]

kiến thức hay quá

[@duc-hainguyen8499]

cam on ban nhe

[@hoangfootball11]

mong kênh bạn sớm đạt được 2k sub🤩🤩

[@duc-hainguyen8499]

cam on ban nhe

[@ThuTrần-x2n]

cảm ơn bạn đã chia sẻ

[@duc-hainguyen8499]

cam on ban rat nhieu

[@tamphuong59]

Kiến thức hay quá

[@duc-hainguyen8499]

Cam on ban nhe

Good 👍👍

[@duc-hainguyen8499]

Thank you! Cheers!

[@VuTruongKhac-xj2vm]

Cảm ơn bạn đã chia se những kiến thức thật hữu ích.

[@duc-hainguyen8499]

Cảm ơn bạn rat nhieu nhe

[@TrungNghiaLe-r4e]

Hay quá bạn ơi

[@duc-hainguyen8499]

cam on ban nhe

[@HongNguyen-cu8si]

Thank for sharing.

[@duc-hainguyen8499]

many thanks

[@tocdoo]

Great ❤!

[@duc-hainguyen8499]

Glad you like it!

[@vanphucduong2892]

Video hay bạn ơi ❤❤❤

[@duc-hainguyen8499]

cam on ban rat nhieu

[@arcthang5329]

Thank your information, it is interesting

[@duc-hainguyen8499]

Glad you think so!

[@aondohembanege9551]

Thanks for the video @Dr. Henry Nguyen... Is it necessary to use all the softwares you used? Can't the same process be done with only 2 of these softwares?

[@duc-hainguyen8499]

You can use different software. However, you need to check your protein and ligand first.

[@thocon16]

Thanks.

[@duc-hainguyen8499]

many thanks

[@Nhon01Tinh]

Hay quá bạn ơi !

[@duc-hainguyen8499]

cam on ban nhe

[@tuananhle411]

Cám ơn đã chia sẽ kiến thức hay ạ

[@duc-hainguyen8499]

cam on ban rat nhieu nhe

[@huyduong326]

Tuyệt vời quá thầy ơi,

[@duc-hainguyen8499]

cam on ban nhe

[@Anhphee]

thanks bạn đã chia sẻ nhé

[@duc-hainguyen8499]

Cam on ban nhe

[@Nhon02Tinh]

Hai quá bạn ơi ❤

[@duc-hainguyen8499]

cam on ban nhe

[@artmedia2023]

Tuyệt cảm ơn đã chia sẻ

[@duc-hainguyen8499]

many thanks

[@lanhlung1]

Video hữu ích tuy không thể hiểu hết tiếng anh hi

[@duc-hainguyen8499]

cam on ban nhe

[@ngaiphuvua]

Very nice ❤

[@duc-hainguyen8499]

Thank you! Cheers!

[@manishakotadiya4673]

It's good work, can I have this article for reference?

[@duc-hainguyen8499]

Thanks for kind responds. Here is my articles for your references: 1. doi.org/10.1016/j.compbiolchem.2023.107872 2. DOI: 10.1080/07391102.2023.2238068

[@thoainhat5738]

Cảm ơn vì chia sẻ nha ad

[@duc-hainguyen8499]

cam on ban rat nhieu

[@LVT_nilah]

Video hay wa😊

[@duc-hainguyen8499]

cam on ban nhe

[@ngocngantyty]

Like, video very good

[@duc-hainguyen8499]

Thank you very much

[@nhungdaothi719]

anh Hải cho em hỏi em đang học docking nên lặp lại phân tích chất 25 của anh nhưng ra docking score là -6.1 ạ, em thao tác cùng lệnh cmd nhưng kết quả không lặp lại thì do đâu ạ? anh có email thì cho em xin để tiện được hỏi anh. E cám ơn anh.

[@duc-hainguyen8499]

Chào bạn, mỗi máy tính sẽ có kết quả hơi khác nhau 1 chút, nhưng không nhiều. Chắc bạn chưa fix protein before docking. Missing residue and atoms, and error in protein structures can explain this reason. Here is two my published papers, can you reference it. Hope it helps. doi: 10.1080/07391102.2023.2238068 and doi.org/10.1016/j.compbiolchem.2023.107872

[@nhungdaothi719]

@@duc-hainguyen8499 Em cám ơn anh đã trả lời ạ, em có làm hết các bước như anh hướng dẫn mà sau đó em lập lệnh nó chạy ra kết quả khoảng -6.8 nhưng nếu em lặp lại lệnh chạy thì nó lại ra kết quả khác ạ, -6.3. Nên em ko rõ làm như nàođể chuẩn nhất và được phép sai số ra sao ạ.

[@duc-hainguyen8499]

@@nhungdaothi719 neu ban da lam tat ca cac buoc roi ma van ket qua nhu the thi ban bao cao ket qua nhu the ban nhe. Ban chon model nao tot nhat de bao cao ban nhe. Ban lam tuong tu voi chat chuan (thuoc da duoc approval). Ban so sanh voi chat chuan (thuoc da duoc approval) thi ket qua cua ban se hop ly thoi. Chuc ban thanh cong.

[@thuythanh-n9i]

🎉🎉🎉

[@duc-hainguyen8499]

many thanks

[@uuigame123]

❤❤❤❤

[@duc-hainguyen8499]

cam on ban rat nhieu nhe

[@GiaThienx]

video hay

[@duc-hainguyen8499]

cam on ban rat nhieu

[@5237TFT]

Hay

[@duc-hainguyen8499]

cam on ban rat nhieu

[@NgoaiBa-v2y]

Hay

[@duc-hainguyen8499]

cám ơn bạn nhe

[@HdPtVN]

cũg lốgic

[@duc-hainguyen8499]

cam on ban nhe

[@johnnguyen059]

Hay quá bạn ơi

[@duc-hainguyen8499]

Cam on ban nhe

[@toichandoi]

Good

[@duc-hainguyen8499]

So nice

[@lêtrần-t3p]

good

[@duc-hainguyen8499]

Thanks

[@SơnBảo-i2v]

Tuyệt vời 🎉cảm ơn bạn đã chia sẻ

[@duc-hainguyen8499]

cam on ban rat nhieu nhe

[@Huylê-m5t]

good

[@duc-hainguyen8499]

Best