Molecular Docking using Chimera and AutoDock Vina

  Рет қаралды 23,276

Ashok Kumar T

Ashok Kumar T

Күн бұрын

This video tutorial explains protein-ligand docking using Chimera and AutoDock Vina tool. The target molecule was retrieved from the RCSB PDB and ligand molecule from the NCBI PubChem database. Public URL for the sources and tools are below,
RCSB PDB - Database for macromolecules
www.rcsb.org/
NCBI PubChem - Database for small molecules
pubchem.ncbi.n...
Chimera - For molecule manipulation and visualization
www.cgl.ucsf.e...
AutoDock Vina - For protein-ligand docking
autodock.scrip... (OR)
vina.scripps.e... (OR)
github.com/ccs...
---------------------------------------------------------------------------------------
My Blog: www.biob.in
Website: www.biogem.org
My Vlog: / ashokkumarbioit
KZbin Handle: / @akbit
My GitHub: github.com/Ash...
---------------------------------------------------------------------------------------
Background Music:
► Music By Scandinavianz - Coco Islands : / ...​
► Music provided by NCS BEST OF : • Video
#BioGem #biogem.org #BioBIN #biob.in #Bioinformatics #AKBIT #NCBI #PubChem #RCSB #PDB #AutoDock #Vina #Chimera #Scripps

Пікірлер: 51
Арыстанның айқасы, Тәуіржанның шайқасы!
25:51
QosLike / ҚосЛайк / Косылайық
Рет қаралды 700 М.
Chain Game Strong ⛓️
00:21
Anwar Jibawi
Рет қаралды 41 МЛН
How to Sell High-End Products Using Psychological Triggers
2:48
Luxury Academy
Рет қаралды 3,1 М.
Autodock Vina Tutorial - Molecular Docking
19:28
Farhan Haq
Рет қаралды 73 М.
Protein Structure Analysis using Chimera Tool
9:20
Ashok Kumar T
Рет қаралды 5 М.
Visualizing Protein-Ligand Interactions || UCSF Chimera
14:59
JeevikaSilicoBio
Рет қаралды 16 М.
Molecular Docking for Beginners | Autodock Full Tutorial
1:50:55
BioinformaticsCopilot
Рет қаралды 36 М.
Protein-ligand docking with AutoDock Vina and UCSF Chimera
35:28
Shayon Bhattacharya
Рет қаралды 28 М.
Tutorial: site specific docking using auto dock vina.
14:26
Bioinformatics Review
Рет қаралды 72 М.
Арыстанның айқасы, Тәуіржанның шайқасы!
25:51
QosLike / ҚосЛайк / Косылайық
Рет қаралды 700 М.