Phylogenetics Part 5 - Maximum Parsimony and Maximum Likelihood methods

  Рет қаралды 49,709

Farhan Haq

Farhan Haq

Күн бұрын

Пікірлер: 43
@suchetanag
@suchetanag 2 жыл бұрын
I would like to thank you. We're having offline exams for the first time after the pandemic, and none of these portions were covered by our professors. Thank you for all the taxonomy videos..
@rajkothari7583
@rajkothari7583 Жыл бұрын
Sir, please check No. of changes in position 7 for tree III is 2 not 1 so the total no. of changes will be 6
@somanathshyamsundar685
@somanathshyamsundar685 Жыл бұрын
correct!
@blaaahhh
@blaaahhh 6 ай бұрын
yeah position 7 for tree III is 2
@deadshot1124
@deadshot1124 4 жыл бұрын
I was not able to find any good explanation on this topic until I found this video.....Great work!!
@FarhanHaqj
@FarhanHaqj 4 жыл бұрын
Glad to know :)
@sengrathanin
@sengrathanin 3 жыл бұрын
I would like you to explain ML aproach in detail like you did for MP aproach. Of all video and bout phylogentic tree, you are the best.
@FarhanHaqj
@FarhanHaqj 3 жыл бұрын
kzbin.info/www/bejne/j3u4mpaBfceKqJY
@sengrathanin
@sengrathanin 3 жыл бұрын
@@FarhanHaqj Thank you so much teacher
@phandc4581
@phandc4581 4 жыл бұрын
Your lesson is very helpful. Thanks for sharing, sir!
@FarhanHaqj
@FarhanHaqj 4 жыл бұрын
Glad to know
@pubgcomedy4650
@pubgcomedy4650 3 жыл бұрын
thank you, your video helped me understand this topic so much
@mthokozisindlovu2079
@mthokozisindlovu2079 Жыл бұрын
There is an error. Position 3 and 6 of tree 3 is 1
@NitishKumar-jp7vg
@NitishKumar-jp7vg 3 жыл бұрын
I think in position 3 of tree 7, number of changes should be 2
@thinhtrangia9427
@thinhtrangia9427 3 жыл бұрын
Yeah, I also think like you. So is it right ?
@suchetanag
@suchetanag 2 жыл бұрын
I have the same confusion, because there should be a change from C to A first ,after orangutan and then A to C for chimpanzee
@rencemarrionpineda2566
@rencemarrionpineda2566 2 жыл бұрын
@@suchetanag mine too. I think it should be 2
@rencemarrionpineda2566
@rencemarrionpineda2566 2 жыл бұрын
but the explanation is great. I am thankful \
@lalitasharma5663
@lalitasharma5663 2 жыл бұрын
I also think it's 2 but otherwise v. Good explanation
@AshishSingh-sy3gn
@AshishSingh-sy3gn 3 жыл бұрын
And why have we made only 3 trees for 4 taxa?
@FarhanHaqj
@FarhanHaqj 3 жыл бұрын
3 possible trees using 3 informative sites.
@iamovereighteen2010
@iamovereighteen2010 3 жыл бұрын
We have assumed Orangutan to be out group, which will give us only three possible trees. This assumption was made just to keep the example simple.
@pranavdatar6250
@pranavdatar6250 Жыл бұрын
At 10.25, why only 3 sites are informative, while the rest sites are non informative?
@deepakmalik3746
@deepakmalik3746 4 жыл бұрын
Sir in 3rd tree total mutations will be 6 I guess
@iamovereighteen2010
@iamovereighteen2010 4 жыл бұрын
You are absolutely right. Total mutations will be 6 (2+2+2).
@SuperVITHURSHAN
@SuperVITHURSHAN 3 жыл бұрын
yes it is 6.
@nimraiftikhar527
@nimraiftikhar527 2 жыл бұрын
Perfect Sir
@gulnigar8425
@gulnigar8425 3 жыл бұрын
Sir, Is there any video lecture on Maximum likelihood method?
@FarhanHaqj
@FarhanHaqj 3 жыл бұрын
We have not uploaded lecture related to ML. Hopefully in future
@gulnigar8425
@gulnigar8425 3 жыл бұрын
@@FarhanHaqj but I need that Sir 😕
@FarhanHaqj
@FarhanHaqj 3 жыл бұрын
kzbin.info/www/bejne/j3u4mpaBfceKqJY
@gulnigar8425
@gulnigar8425 3 жыл бұрын
Thank you so much Sir. Thanks a lot 🙏
@girichemicalbiology7273
@girichemicalbiology7273 Жыл бұрын
@minimishra476
@minimishra476 3 жыл бұрын
Sir which one is more accurate ?
@FarhanHaqj
@FarhanHaqj 3 жыл бұрын
Maximum likelihood
@魏凡淳-z2q
@魏凡淳-z2q 3 жыл бұрын
awesome
@malaikazahid1418
@malaikazahid1418 4 жыл бұрын
Sir how can students contact you ?
@FarhanHaqj
@FarhanHaqj 4 жыл бұрын
You may ask your questions here. We will be happy to respond
@AshishSingh-sy3gn
@AshishSingh-sy3gn 3 жыл бұрын
Sir why did we choose G as the ancestral sequence in tree 1 and not A
@FarhanHaqj
@FarhanHaqj 3 жыл бұрын
We assumed G because it was present in Orangutan which is our outgroup in this tree
@ziatmg95
@ziatmg95 2 жыл бұрын
Agar ap urdu my explain krte tu Acha hota
Phylogenetics  Part 3 - Steps in building a phylogenetic tree
29:01
Character-based methods
18:42
Biotech and Bioinformatics with Prof Greg
Рет қаралды 4,1 М.
路飞做的坏事被拆穿了 #路飞#海贼王
00:41
路飞与唐舞桐
Рет қаралды 25 МЛН
Леон киллер и Оля Полякова 😹
00:42
Канал Смеха
Рет қаралды 3,9 МЛН
Players push long pins through a cardboard box attempting to pop the balloon!
00:31
Parsimony
6:26
Dr. Claire Says
Рет қаралды 89 М.
Maximum Likelihood, clearly explained!!!
6:12
StatQuest with Josh Starmer
Рет қаралды 1,4 МЛН
Phylogenetics Part 4 - Neighbor Joining Method
22:59
Farhan Haq
Рет қаралды 50 М.
Maximum likelihood
22:07
Anders Gorm Pedersen
Рет қаралды 41 М.
Я купил Lada Aura
41:40
Клубный сервис
Рет қаралды 450 М.
Pharmacophore Analysis
40:00
Primal Bioinformatics
Рет қаралды 48
Maximum Parsimony
7:49
Anders Gorm Pedersen
Рет қаралды 66 М.
Maximum Likelihood Estimation
15:02
Keiffer Williams
Рет қаралды 8 М.
Phylogenetics - Maximum Likelihood Method
17:44
Farhan Haq
Рет қаралды 15 М.
Phylogenetic trees: the basics
18:20
Biotech and Bioinformatics with Prof Greg
Рет қаралды 13 М.
路飞做的坏事被拆穿了 #路飞#海贼王
00:41
路飞与唐舞桐
Рет қаралды 25 МЛН