ถ้าฟังสรุปตอนนีโอคุยกับสถาปนิกในภาคสุดท้าย นีโอคือ the one คนที่ 6 ครับ ในช่วงเวลาที่เครื่องจักรยึดครองโลก มี the one มา 5 คนแล้ว the one ก็คือ bug ที่เครื่องจักรวางไว้ตั้งแต่แรกเริ่ม เครื่องจักรพบว่าจิตใจมนุษย์ซับซ้อนมากๆ ดังนั้นในระหว่างการดำเนินชีวิตในเมทริกซ์ จะมีมนุษย์บางส่วนเริ่มจะรู้สึกหรือสัมผัสได้ว่าสิ่งที่ตัวเองเจอมันไม่ใช่ของจริง ถ้าเกิดมีมนุษย์เริ่มจะรับรู้ตัวตนของเมทริกซ์เรื่อยๆ การควบคุมจะลำบาก ดังนั้นเครื่องจักรเลยเอาพวกนี้ไปรวมกันในที่ๆเดียวดีกว่า นั่นก็คือ ไซออน โดยวางโปรแกรมไว้ตัวหนึ่ง เรียกว่าโปรแกรม the one เสมือนเป็น bug ของระบบ เป็นผู้ชี้นำคนที่หลุดออกจากเมทริกซ์ เพื่อง่ายต่อการควบคุม ทีนี้พอคนที่หลุดจากเมทริกซ์มีมากๆเข้า เครื่องจักรก็จะรีเซ็ตระบบครั้งหนึ่ง โดยสร้างสถานการณ์ให้ the one เป็นคนเลือกกับสถาปนิกระบบ โดยที่ผ่านมา the one ทั้ง 5 คน เลือกทางเดียวกัน ทำให้ไซออนถูกทำลาย (ไซออนโดนล้างบางมา 5 รอบแล้ว) แต่ในรอบนีโอเกิดสิ่งที่แปลกไปสองอย่าง คือสมิธดันกลายเป็นไวรัสซะเอง กับนีโอเลือกทางเลือกอีกทาง โปรแกรมเมทริกซ์เลยเพี้ยนไปจากที่เครื่องจักรตั้งใจไว้ตั้งแต่ทีแรก