Tuto ACP sur R avec Factoshiny et FactoMineR

[@guerschommugisho5569]

Vous êtes admirable Mr François. Merci pour vos vidéos

[@lelysdanslavallee30]

c'est tellement bien expliqué, merci beaucoup !!

[@MajidBenhenneda]

Excellent travail, merci beaucoup et bonne continuation.

[@ahmedrahmoune6841]

Une question si vous permettez, comment choisir les variables ou les individus supplémentaire i.e: sur quel critère on décide tel individus est supplémentaire ou telle variable est supplémentaire.Merci.

[@saoudimounir5952]

bonjour , la rédaction du rapport ne marche pas avec moi je lance la rédaction et aucun chose afficher

[@aminsawadogo2300]

Bonjour! j'ai réalisé l'ACP avec l'interface Factoshiny, cependant quand je télécharge le rapport automatique sous format word, ça tourne mais aucun résultat; également quand je quitte pour observer l'arbre hiérarchique, c'est toujours le même scénario, ça tourne mais aucun résultat. Aidez moi svp!

[@olivierlouail482]

Bonjour et merci pour cette excellente ressource. Concernant les indicateurs de "qualité" de l'ACP: existe-t-il des seuils en-dessous desquels il faut abandonner l'interprétation d'une donnée? Par exemple, pour caractériser la qualité de représentation d'une variable ou d'un individu dans un plan factoriel vous expliquer qu'il faut faire la somme des cos² sur les 2 premiers axes. En-dessous de quelle valeur de cos² pour un plan factoriel doit-on considérer que les variables doivent être écartées dans l'interprétation du plan factoriel? que le plan factoriel ne représente pas bien l'individu?

[@sarahjouan8814]

Bonjour, petite question. Je suis bloquée à la partie ind.sup, quali.sup et quanti.sup pour mon projet perso. Je ne sais pas à quoi cela correspond concrêtement... merci d'avance

[@HussonFrancois]

ind.sup correspond au x individus supplémentaires, quali.sup aux variables qualitatives suplémentaires et quanti.sup aux variables quantitatives supplémentaires (voir la vidéo 3 sur les aides à l'interprétation dans le cours husson.github.io/MOOC_AnaDo/ACP.html pour plus de précision). Ces éléments seront présents sur les graphes mais n'auront pas participer à la construction des dimensions.

[@sarahjouan8814]

Merci de votre réponse, je vais regarder ça. Par exemple si ma première colonne est le nom des pays européens, je vais écrire quali=sup(1)? Et également pour ma première ligne qui correspond au titre de mes colonnes ? Merci d'avance, Et merci de vitrée réponse

[@burg.ste_her6496]

Chèr François, merci beaucoup pour votre travail et les excellents tutos! Une question concernant le rapport automatique : Qu'est-ce qui est évalué exactement dans le test de Wilk pour les variables qualitatives supplémentaires ? J'ai deux variables qualitatives supplémentaires dans mon ensemble de données. L'une regroupe les individus en fonction de la "condition de traitement", l'autre en fonction de la "réplique". Dans le test de Wilk rapporté, il semble que les différentes répliques séparent mieux les individus que la condition de traitement. Je ne suis pas certain comment je peux présenter ce résultat dans mon rapport, car je ne vois pas bien quels calculs ont conduit à ce résultat. Est-ce qu'il indique que les moyennes des groupes sont significativement plus différentes que celles d'un groupe d'individus indépendants ? Merci encore !

[@Talwyn412]

Bonjour, j’essaie de lancer le package factoShiny sur R studio pour Mac et j’ai un message d’erreur qui me dit d’installer un programme qui s’appelle X11. Est-ce que c’est un autre package trouvable dans l’application ? Est-ce qu’il existe une alternative ?

[@HussonFrancois]

Bonjour, comme vous êtes sur Mac, je pense qu'il vous suffit de mettre à jour Xquartz

[@Talwyn412]

@@HussonFrancois Merci beaucoup pour votre réponse ! Je l’ai fait et j’arrive à lancer le package. Cependant, l’interface me dit error could not find function « pca » de ce fait, aucun graphique ne s’affiche 😕 Sauriez-vous comment y remédier ?

[@jeandenys7]

Bonjour M. Francois, Merci pour cette instructive presentation. J'amerais savoir s'il ya possibilite d'avoir un rapport automatique pour le FAMD? Coe c'est pas dans l'interface de Factoshiny, si oui, quel script a utiliser. Merci!!

[@ponaparte4825]

Bonjour, merci pour la qualité de l'explication. J'ai un petit problème. Si j'essaye de faire une ACP avec un de mes fichiers Csv, je n'y arrive pas car lorsque j'importe le fichier (mêmes commandes que pour décathlon) mes variables ne sont pas quantitatives. Comment changer cela ? Merci

[@HussonFrancois]

Le pb doit être dû au format de vos données. Le séparateur de décimal est-il le "." ou la "," ? Il faut préciser avec l'argument dec dans la fonction read.table.

[@ponaparte4825]

@@HussonFrancois Merci pour votre réponse. Problème réglé !

[@ponaparte4825]

@@HussonFrancois Bonjour, est-il possible de créer le graphe des anciennes variables dans le repère des valeurs propres avec R studio ou factoshiny, afin de m'aider dans l'interprétation de mes axes ?

[@HussonFrancois]

Il faut importer vos données correctement. C'est la phase d'importation qu'il faut bien gérer/

[@soukainaabi-ayad6825]

Bonjour, la rédaction pour le rapport ne marche pas pour moi, comment on peut le faire ?

[@ericc7108]

Bonjour, merci pour ces explications précieuses. j'ai réalisé une acp sur mon jeu de données (complet), pourtant dans la description automatique des axes, il est indiqué "valeur manquante là où TRUE / FALSE est requis". Comment résoudre cette erreur ?

[@HussonFrancois]

Bonjour, cela peut arriver si la 1ère colonne du jeu de données contient le nom des individus et que vous avez considérez cette colonne comme une variable qualitative supplémentaire (ce n'est pas une variable, il faut importer le jeu de données en précisant que la 1ère colonne contient le nom des individus).

[@maximepelissier4629]

Bonjour monsieur, merci beaucoup pour ces explications et ce package ! Petite question, j'ai cru comprendre que l'estimation des données manquantes par FactoShiny se faisant par une ACP itérative pour les options 2 et 3, ma question est de savoir si cette estimation par ACP itérative est régularisée ? Par rapport à l'une de vos anciennes vidéos sur l'intérêt de l'ACP itérative régularisée. En vous remerciant.

[@HussonFrancois]

Oui, l'ACP itérative utilisée est bien régularisée dans Factoshiny

[@maximepelissier4629]

@@HussonFrancois Merci beaucoup pour cette réponse rapide, c'est encore mieux alors !

[@baotana191]

Bonjour, merci de votre vidéo. Mais comment faire un ACP ou ACM avec pondération ? S'il vous plaît ? Car dans votre base, il n'existe pas de valeur de pondération, j'aimerais savoir comment tenir en compte de la pondération dans Factoshiny...merci !

[@HussonFrancois]

Bonjour, Pour la pondération, il faut utiliser l'argument row.w dans les fonctions PCA ou MCA dea FactoMineR. Ce n'est pas possible d'avoir de pondération avec Factoshiny.

[@baotana191]

@@HussonFrancois merci monsieur Husson !!!

[@chadibenchakroun6465]

Bonjour Monsieur, les individus bien représentés sur le plan principal sont-ils souvent les mêmes que ceux contribuant le plus à la construction de ce même plan? D'avance merci pour votre réponse, et pour cette excellente vidéo.

[@HussonFrancois]

Pas nécessairement. Un individu qui est proche du centre du nuage peut être proche du plan. Maintenant, les individus qui sont très extrêmes contribuent beaucoup à la construction des axes et sont bien projetés.

[@kpreakajeannoel8365]

Comment avoir le package "Factoshiny"?

[@bousbiaaissam198]

j'ai pas pu télécharger la fonction Factoshiny dans R studio et comment on déclare les variables qualitatives

[@bgr225]

Bonjour est ce que vous avez au préalabre télécharger le package avec la fonction suivante install.packages("Factoshiny"), puis la charger avec library(Factoshiny)?

[@sabrinesabrina7255]

je peux pas avoir l interpretation je sais pas pourquoi, la page se bloque

[@sabrinesabrina7255]

pour le rapport

[@zohbimichael8262]

Très bon tutoriel, merci. Une question: Comment savoir quelles variables retranchée après l ACP?

[@LulusCommentdansR]

Belle question..

[@DembaBa-v8g]

Vos explications sont claire et net, existe t-il une autre méthode de l'importation les données sur R

[@khalifaababacardiop1469]

Bonjour merrci pour cette video. Par contre j'ai un problème à chaque fois que j'ouvre cet interface factoshiny en ligne à la fin j'arrive pas à fermer R. je dois toujours redemarrer ou arreter mon ordinateur.

[@HussonFrancois]

Il faut bien cliquer sur le bouton "quitter l'application" en bas du panneau de droite dans Factoshiny

[@zohirmelzi1535]

Bonsoir monsieur Husson. Merci et bravo pour tout ce que vous avez effectué, concernant l'analyse multidimensionnelle sous R, notamment avec les packages Factominer et Factoshiny. Cependant, j'ai un souci avec l'édition automatique de rapports : les pages "se grisent" au bout de quelques secondes et elle se "figent", avec un message d'erreur en arrière-plan sous RStudio. Auriez-vous une petite idée, sur ce souci ? Merci encore.

[@HussonFrancois]

Bonjour, Il faut une version de R 4.0 ou plus récente, et les dernières versions des packages FactoMineR, Factoshiny et FactoInvestigate.

[@idisosthenemanirakiza5992]

Bonjour, Merci pour un super travail. Mais, je n'arrive pas à trouver la bibliothèque de factoshiny, comment peux-je faire? Aidez-moi svp

[@mohameddjalimchifaou2971]

ça doit être la version de R que vous avez installer. Je pense qu'il faut installer la nouvelle version.

[@soufianeechchaari5081]

Mr francois i didn't find scrip pca in shiny without using factoshiny is there any pca method in shiny

[@HussonFrancois]

Of course, this is explained in this video

[@soumeyachahed7503]

Merci beaucoup pour votre explication, j'ai un problème, je veux appliquer ça avec mes propres données, mais ces commandes me donnent votre exemple! comment faire pour travailler avec mes données svp!!

[@fatoumatacisse8704]

Superbe,j aimerai savoir comment les données de type numérique et char d une meme BD peuvent être manipulées si possible.

[@HussonFrancois]

Bonjour, Vous pouvez voir cette vidéo : kzbin.info/www/bejne/jWLQqmB6etSDkJI

[@sidatibtr3211]

bonjour ,la redaction du rapport prend combien du temps

[@HussonFrancois]

Quelques secondes

[@sidatibtr3211]

@@HussonFrancois il ne marche pas avec moi je lance la redaction et aucun chose afficher est ce que il y'a un probleme a quelque part

[@khalifaababacardiop1469]

@@HussonFrancois Bonjour merci pour ce travail mais la rédaction ne marche pas pour moi

[@nickyves9714]

merci beaucoup, très belle vidéo. pensez vous que je puisse trouver un pareil module sur Python?

[@HussonFrancois]

Bonjour, Non il n'y a pas d'équivalent sous python.

[@TheMagikG]

Impossible de lancé Factoshiny...

[@katienefoasoro929]

salut Mr François