CheckM for Genome Consistency

  Рет қаралды 2,555

RobEdwards

RobEdwards

Күн бұрын

Dr. Rob Edwards from San Diego State University describes how the CheckM approach for measuring genome consistency works.

Пікірлер: 4
@ThuyNguyen-km1cc
@ThuyNguyen-km1cc 4 жыл бұрын
thank you. It is a great explanation about CheckM
@mattjohnstone5324
@mattjohnstone5324 5 жыл бұрын
What would you recommend is the best way to visualise all the data generated from checkM?
@marianodanielelean9039
@marianodanielelean9039 Жыл бұрын
Working with checkM the shell output this error: ERROR: No bins found. Check the extension (-x) used to identify bins. Any idea what should I do? How should I organized the folders? Is there any guide?
@carinerodrigues9217
@carinerodrigues9217 Жыл бұрын
You can use -x fasta for exemple.
Why does paired end sequencing help assembly?
4:51
RobEdwards
Рет қаралды 39 М.
Getting a job in academia - Darren Lipomi - UC San Diego
52:35
Darren Lipomi
Рет қаралды 25 М.
Let's all try it too‼︎#magic#tenge
00:26
Nonomen ノノメン
Рет қаралды 53 МЛН
How did CatNap end up in Luca cartoon?🙀
00:16
LOL
Рет қаралды 7 МЛН
ПЕЙ МОЛОКО КАК ФОКУСНИК
00:37
Masomka
Рет қаралды 9 МЛН
Genome Peek
6:09
RobEdwards
Рет қаралды 933
ABACBS Presentation 2020
28:57
RobEdwards
Рет қаралды 1,7 М.
Jim Sinegal - Provost Lecture Series Spring 2017
1:10:57
San Diego State University
Рет қаралды 23 М.
Thinking About the Brain with V.S. Ramachandran - Conversations with History
56:56
University of California Television (UCTV)
Рет қаралды 14 М.
वीडियो गेम वाला कैरियर || आचार्य प्रशांत
1:00
आचार्य प्रशान्त - Acharya Prashant
Рет қаралды 219 М.
ASM 2021 Phage and IBD
15:45
RobEdwards
Рет қаралды 2,1 М.
A CPA Exam Q&A at San Diego State University
40:09
UWorld Accounting
Рет қаралды 3,8 М.
Stuart Collection at UCSD: Tim Hawkinson
3:47
University of California Television (UCTV)
Рет қаралды 6 М.
"Unconventional" Careers for PhDs - Darren Lipomi - UC San Diego
42:55
Let's all try it too‼︎#magic#tenge
00:26
Nonomen ノノメン
Рет қаралды 53 МЛН