Examining DNA Sequence Content with Basic Python

  Рет қаралды 7,129

Professor Hendrix

Professor Hendrix

Күн бұрын

Пікірлер: 2
@tinacole1450
@tinacole1450 3 жыл бұрын
How do you loop thru a fasta file to find matches to a text file using bash script.
@ProfessorHendrix
@ProfessorHendrix 2 жыл бұрын
you could use grep, as in "grep ACGT file > output" then you could count the matches with "wc output"
Reverse Complement using Basic Python
10:10
Reverse Complement using Basic Python
Professor Hendrix
Рет қаралды 4,6 М.
Introducing the Biopython SeqIO Module: Reading FASTA files
14:38
Introducing the Biopython SeqIO Module: Reading FASTA files
Professor Hendrix
Рет қаралды 14 М.
Миллионер | 1 - серия
34:31
Миллионер | 1 - серия
Million Show
Рет қаралды 3 МЛН
This mother's baby is too unreliable.
00:13
This mother's baby is too unreliable.
FUNNY XIAOTING 666
Рет қаралды 40 МЛН
Un coup venu de l’espace 😂😂😂
00:19
Un coup venu de l’espace 😂😂😂
Nicocapone
Рет қаралды 12 МЛН
ЭКСКЛЮЗИВ: «Папа мені көп ұратын!» Біреудің семьясын бұздым деп айта алмаймын! Алғашқы сұхбат
2:20:23
ЭКСКЛЮЗИВ: «Папа мені көп ұратын!» Біреудің семьясын бұздым деп айта алмаймын! Алғашқы сұхбат
НТК Show
Рет қаралды 833 М.
Protein translation from RNA sequence using PYTHON | Bioinformatics | Akash Mitra
24:58
Protein translation from RNA sequence using PYTHON | Bioinformatics | Akash Mitra
Akash Mitra
Рет қаралды 11 М.
Bioinformatics with Biopython - Full Course | 1 hour Python for Bioinformatics tutorial
1:00:45
Bioinformatics with Biopython - Full Course | 1 hour Python for Bioinformatics tutorial
Lana Dominkovic
Рет қаралды 38 М.
Python Decorators in 15 Minutes
15:14
Python Decorators in 15 Minutes
Kite
Рет қаралды 446 М.
Bioinformatics in Python: DNA Toolkit. Part 3: GC Content Calculation
14:16
Bioinformatics in Python: DNA Toolkit. Part 3: GC Content Calculation
rebelScience
Рет қаралды 15 М.
Parsing FASTQ files with the Biopython SeqIO module
15:23
Parsing FASTQ files with the Biopython SeqIO module
Professor Hendrix
Рет қаралды 5 М.
Finding the GC count of a DNA sequence using PYTHON | Bioinformatics | Akash Mitra
13:04
Finding the GC count of a DNA sequence using PYTHON | Bioinformatics | Akash Mitra
Akash Mitra
Рет қаралды 6 М.
Protein Sequence Analysis of Covid19 using BioPython
56:18
Protein Sequence Analysis of Covid19 using BioPython
JCharisTech
Рет қаралды 29 М.
Fast Inverse Square Root - A Quake III Algorithm
20:08
Fast Inverse Square Root - A Quake III Algorithm
Nemean
Рет қаралды 5 МЛН
Bioinformatics in Python: DNA Toolkit. Part 1: Validating and counting nucleotides.
13:39
Bioinformatics in Python: DNA Toolkit. Part 1: Validating and counting nucleotides.
rebelScience
Рет қаралды 82 М.
Reading a FASTA file with basic python
16:25
Reading a FASTA file with basic python
Professor Hendrix
Рет қаралды 6 М.
Миллионер | 1 - серия
34:31
Миллионер | 1 - серия
Million Show
Рет қаралды 3 МЛН