MOE, (2) Protein Preparation, Karmalawy

[@choooo448]

يعني فيديو توضيحي رائع اسال الله ان يجزيك عن الامة الاسلامية خير جزاء

[@medicinalchemistrywithkarm5852]

الله يكرمك ويبارك فيكى ويسعدك.. ربنا ينفع بينا جميعاً إن شاء الله 💐🌸

[@gameplus707]

بارك الله فيك وزادك في علمك واعلي قلمك من افضل ماسمعت من عالم يعطي بكل قوته باافضل اسلوب واسهل طريقة بكل حبا واجمل عطاء حفظك الله

[@medicinalchemistrywithkarm5852]

أعزك الله ورفع من قدرك 🌷💐

[@xxmusicxx1917]

Please record a video of your MOE tutorials in English if possible, it would be helpful to others as we don't know this language.

[@medicinalchemistrywithkarm5852]

Ok, as soon as possible

[@elhassasnasouhir1647]

شكرا لك على الموضوع المميز جزاك الله كل خير جعله الله في ميزان حسناتك لك كل الشكر والتقدير احترامي

[@medicinalchemistrywithkarm5852]

وإياكم اللهم آمين 🌺

[@borhanmohamed626]

شرح ممتاز جدا يا دكتور

[@medicinalchemistrywithkarm5852]

شكراً جزيلاً.. بالتوفيق 🌻

[@ramialkhalile]

شكرا دكتور🌹،محتواك هام واتمنالك التوفيق.

[@medicinalchemistrywithkarm5852]

شكراً جزيلاً لحضرتك.. تحياتى 🌻

[@emanwarda7545]

حقيقى لو اعدت اشكر حضرتك من هنا لاخر يووم ف عمرى بجد مش هوفيك حقك بجد شكرا ان حضرتك حبيت تفيييد بجد وتفهمنا انا بقالى شهريين بدور علشان افهم فييه وللاسف قليل من يتحدث عن البرنامج اتمنى ان حضرتك تكمل السلسه دى

[@medicinalchemistrywithkarm5852]

ربنا يكرمك ويوفقك دايماً ويسعدك.. ربنا ينفع بينا جميعاً وييسرلك أمورك.. ان شاء الله تعالى 🌻❤️

[@hsabulkhair]

مجهود مشكور د. قرملاوى و محتوى حقيقى مفيد ... ربنا يوفقك و إستمر فى إفادة متابعيك ... لو ممكن ترجمة الكلام مبدئيا بالإنجليزية و ظهورها كنصوص كتابية على الشاشة لتعظيم الإستفادة للناطقين بغير العربية. تقبل تحياتى

[@medicinalchemistrywithkarm5852]

شكراً جزيلاً د حماده.. ربنا ينفع بينا جميعاً إن شاء الله 💐

[@khyasemin6318]

ممتاز يادكتور شرح جميل جدا وقله الفديوهات الي تشرح البرنامج ياريت تكمل السلسلة على كل استخداماته مش بس الدوكنك واي حاجة تخص drug designاو medicinal chemistry

[@medicinalchemistrywithkarm5852]

شكراً جزيلاً.. وبالتوفيق إن شاء الله 🌻🌻

[@khyasemin6318]

@@medicinalchemistrywithkarm5852 حضرتك شرحت كويس عن PDBولكن ياريت محاضرة عن تفاصيل اكثر عن الموقع وازي نقدر نستفاد من معلوماته وايه معنى المعلومات الي مكتوبة عن البروتين والرزليوشن مين احسن حاجة استعملها او اي طريقة لتصوير البروتين هي الاحسن زي X ray او اي طريقة اخرى

[@khyasemin6318]

@@medicinalchemistrywithkarm5852 عندي سؤال يادكتور لو انا عملت databaseمن غير مااعمل تحضير للمركبات هل ممكن اعمل preperation للمركبات بعدين كلهم سوا ولا لازم واحد واحد لو هم كثير مثلا

[@medicinalchemistrywithkarm5852]

@@khyasemin6318 ممكن من database window ولكن الأفضل قبل الإدخال

[@medicinalchemistrywithkarm5852]

@@khyasemin6318 إن شاء الله

[@mahmoudalsayed8986]

شكرا جدا لحضرتك ربنا يجزيك كل الخير

[@medicinalchemistrywithkarm5852]

وإياكم أن شاء الله 🌷

[@maroochem]

ممتاز الشرح كنت حاسة انه اصعب من كدة شكرا جزيلا الحقيقة رائع بس اسمحلى تستمر لاى شئ يخص الmedicinal chemistry و كمان اسمحلى اسألك لو فيه مشكلة

[@medicinalchemistrywithkarm5852]

لا أبداً حضرتك تتفضلي فى أى وقت.. ممكن التواصل عن طريق Facebook account

[@medicinalchemistrywithkarm5852]

شكراً جزيلاً لكلامك المحترم.. وربنا ينفع بينا جميعاً 🌻🌸

[@magicdiamond8767]

هل نحتاج خطوة energy minimization عند تحضير البروتين ؟

[@salmahassan7572]

سلام عليكم ورحمة الله . جزاك الله خير عايز ه أعرف عن البروتينات والأحماض الأمينية معلومات أكتر وأعمق فلو في قنوات معينه تمدني بيها اكون ممتنه

[@ES-yd1ze]

مو المفروض بال docking دائما ازيل ال water بخلاف ال MD SIMULATION?? وكيف اعرف ان الماء داخل بال interaction ام لا ؟؟ شكرا ع سعة صدرك دكتور ارجو الاحابة

[@magicdiamond8767]

دكتور لو سمحت انا بحظر البروتين يعطي قطع في الببتيد لعدد من الاحماض الامينية ثم يكمل حوالي ١٠ احماض امينية هل شغلي صح ولا غلط

[@magicdiamond8767]

اذا البروتين يحوي اكثر من موقع ممكن نعمل له ارساء فكيف نختار الافضل هل هو الاكبر ام هناك عوامل اخرى ؟

[@medicinalchemistrywithkarm5852]

If it does not contain a co-crystal ligand, choose the largest pocket.

[@magicdiamond8767]

@@medicinalchemistrywithkarm5852 THANK U SO MUCH

[@elrhaborisaid6128]

شكرا دكتور. أنا أشتغل بنفس البرنام لكن 2009 فهل من فرق؟

[@medicinalchemistrywithkarm5852]

الفروق بسيطة جداً إن شاء الله

[@manalmimi665]

اريد معرفة البرامج التي تستعمل لمحاكاة البروتيين اناا لدي Gaussian فهل هذا كاف لدراسة بروتيين لايجاد علاج لمرض ما

[@almche8978]

شكرا دكتور ممكن رابط تحميل البرنامج لان الرابط الاول بعد دخول الموقع يتحمل كملف مضغوط وبعد فك الضغط وعلشان نبدا تحميل البرنامج ع الكمبيوتر يرفض وعاوز كود اخر

[@mohamedmastouri7349]

Thank you

[@medicinalchemistrywithkarm5852]

🌺🌺

[@alinajami5664]

how to get the program for Mac or windows if you have version could you send it to me plz?

[@maroochem]

من فضلك يا دكتور انا لما اعمل بحث عن البروتين ازاى اطلع الid يعنى لو انا عامله for anticancer HepG2

[@maroochem]

احصل على البروتين باى رمز لان الرموز فى البنك كثير

[@medicinalchemistrywithkarm5852]

ممكن بحث بإسم reference drug co-crystallized with protein

[@maroochem]

@@medicinalchemistrywithkarm5852 على موقع البنك و للا بصفة عامة الى ان يظهر الرمز

[@medicinalchemistrywithkarm5852]

Plz, contact me on messenger

[@hamadaknany8826]

بعد اذنك يا دكتور خطوة type and connect ممكن استغني عنها لو انا دخلت علي compute- structure preparation و عملت correct لكل الاخطاء في خانة ال issues ???

[@medicinalchemistrywithkarm5852]

ينفع أكيد 👍

[@hamadaknany8826]

@@medicinalchemistrywithkarm5852طب امتى احدد site of docking ل dummies و امتى ligand site

[@medicinalchemistrywithkarm5852]

ملهاش قاعده.. حسب عوامل كتير منها طبيعة البروتين

[@hamadaknany8826]

@@medicinalchemistrywithkarm5852 شكرا جدا يا دكتور

[@hanaelkhalifa2630]

@@medicinalchemistrywithkarm5852 ممكن شرح اكتر عن ال dummies و الفرق بينها وبين استخدام isolate atoms & backbone

[@rahulrathore1368]

Sir please dub this video in english also....👍

[@medicinalchemistrywithkarm5852]

AS soon as possible isa 👍🌻

[@mohammedmerzouki5542]

شكرا جزيلا كيف يمكن إستغلال النتائج محصل عليها

[@tarekyousef6165]

السلام عليكم ورحمة الله وبركاته جزاكم الله خيرا علي هذا الشرح الرائع اريد التواصل مع حضرتك لو سمحت

[@medicinalchemistrywithkarm5852]

وعليكم السلام ورحمة الله وبركاته.. يمكنك التواصل Facebook 🌻

[@mohammedmerzouki5542]

سلام دكتور. رمضان كريم. من فضلك ممكن تقدم لنا عروض حول إستخدام docking بواسطة برنامschrodinger maestro. شكراااا

[@medicinalchemistrywithkarm5852]

ان شاء الله قريباً

[@manalmimi665]

لدي سؤال هل استطيع باستعمال Gaussian دراسة البروتيين يعني اريد ان اعرف البرامج المستعملة لمحاكاة بروتيين قصد ايجاد علاج لمرض ما ماذا تنصحني استعمله

[@medicinalchemistrywithkarm5852]

للأسف ليس تخصصى 🌺

[@almche8978]

ممكن رابط التحميل دكتور ربنا يخليك

[@mohammedmerzouki5542]

سلام أستاذ. ممكن فيديو حول طريقة إستعمال pharmacophore بإستعمالMOE. وشكرااا جزيلا لك😍

[@medicinalchemistrywithkarm5852]

ان شاء الله قريباً 🌸

[@almche8978]

ممكن سؤال دكتور لو الطالب حضر مركبات جديده في المعمل ونعتبرها ليجاندات هنا ازاي نختار البروتين المناسب ...ممكن حضرتك توضح الشرح بمثال من بيبر على اي اساس اختاروا البروتين المناسب لشغلهم من بروتين داتا بنك يناسب الليجاندات اللي حضروها في المعمل

[@يومياتروز-غ6ث]

السلام عليكم. يا ريت لو لقيتي اجابة تنوريني

[@magicdiamond8767]

لماذا لم نفصل الكند من الببتيد

[@medicinalchemistrywithkarm5852]

الكند ؟

[@magicdiamond8767]

@@medicinalchemistrywithkarm5852 Ligand

[@ومضاتمضيئة-م8ك]

جزاك الله خيرا يا دكتور و نفع بك الشرح مفصل و أفادني كثيرا الحمدلله ممكن بعد اذنك سؤال هو في اختيار site finder هل ممكن أختار كل Sites الموجودة و اعمل لها isolation في خطوة واحدة او ستكون عملية docking غير دقيقة

[@medicinalchemistrywithkarm5852]

ممكن تفصلي كل site وهتكون عملية docking منفصله لكل واحد

[@ومضاتمضيئة-م8ك]

@@medicinalchemistrywithkarm5852 يعني ما ينفع احدد كل sites الموجودة في خطوة واحدة بدل فصل كل site لوحده؟ و بالنسبة لاختيار Dummys متى نختارها اثناء تحديد site finder وهل اذا اخترناها نغير في ايقونة dock في site ligand atom إلى Dummy atoms? آسفة على الإطالة و جزاك الله خيرا

[@ThanhNguyen-rd5nl]

Can you help me. Why you delete other chain? thank you so much

[@medicinalchemistrywithkarm5852]

Either may be similar chains or we retain the chain containing the co-crystallized ligand

[@ThanhNguyen-rd5nl]

@@medicinalchemistrywithkarm5852 thank you

[@MinaMina-eq3rv]

ازاي انزل برنامج moe ببلاش

[@mixtureofmedia]

اكتب ايميلك ارسلك رابط التنزل. عندي نسخة 2019

[@salmahassan7572]

@@mixtureofmedia وانا برضوا عايز ه

[@ES-yd1ze]

​@@mixtureofmedia كيف حالكم يا دكتور يا عالم دائما تتحفنا بتعليقاتك الرائعة جزاك الله خيرا هل يمكن أن اعمل dynamics by MOE?

[@زكرياالسامعي-ض3ز]

السَلآْم عَلْيُكّمٌ وٍرٍحَمُةّ الله وٍبُرٍكآتُهْ يمكن يادكتور اتوصل بك ع الخاص عندي مشروع تخرج وانا بحاجه لك ابليززززز ساعدني