Microbiome Discovery 9: UniFrac

  Рет қаралды 30,362

Dan Knights

Dan Knights

Күн бұрын

Пікірлер: 22
@enerj86
@enerj86 5 жыл бұрын
best series on youtube, I have watch it like 10 times
@불꽃까리남
@불꽃까리남 8 жыл бұрын
Hi Mr knights I'm a graduate student in Korea studying gut brain axis your video was a huge help for me to understand papers thanks again
@eduardobagagli8998
@eduardobagagli8998 5 жыл бұрын
Thanks a lot for the excellent presentations. Cheers from Brazil.
@lp9342
@lp9342 8 жыл бұрын
hi.thank you very much for your valuable videos!!!! U rock! cheers from Europe
@revolution77N
@revolution77N 6 жыл бұрын
Thank you for these amazing lectures! I'm speechless!!
@pingshaouyu3711
@pingshaouyu3711 3 жыл бұрын
Thank you for the presentation! It really helps!
@VSerman13GR
@VSerman13GR 4 жыл бұрын
Wow, another amazing video! Definitely I will watch the whole course. One question, what would have happened if instead of using Spearman you would have used Pearson correlation?
@argael1
@argael1 3 жыл бұрын
Thank you so much!!!, you save my weekend!
@cristianjaviermena6955
@cristianjaviermena6955 Жыл бұрын
thanks Doc!!! so clear.
@ahmedgroof
@ahmedgroof 2 жыл бұрын
you are a life saver, thank you
@hainguyenthi1853
@hainguyenthi1853 5 жыл бұрын
Thank you very much for nice presentation!
@alfredoalarconyanez4896
@alfredoalarconyanez4896 3 жыл бұрын
Great video, thanks
@kirasorochkina2612
@kirasorochkina2612 2 жыл бұрын
Thank you for the lecture. Is there a reason why you recommend to calculate the unifrac distance matrix in QIIME and not in R?
@dademarty
@dademarty 5 жыл бұрын
Thanks Dan for this video. I was wondering if it wouldn't be more appropriate to use Mantel test instead of Spearman correlation test when comparing distance (physical or ecological) matrices? Bests
@balamurugansadaiappan858
@balamurugansadaiappan858 4 жыл бұрын
Amazing lecture. Thank you
@monicasteffimatchado1780
@monicasteffimatchado1780 4 жыл бұрын
Is it possible to calculate unifrac distance matrix between the OTUs?
@katherinechau5594
@katherinechau5594 3 жыл бұрын
How come when I color my plot, it doesn't work at all. All datapoints are the same colour no matter what I do despite there clearly being different sample types in my dataset. How does your "LAYER" column look? are they discrete values, continuous values, or character strings?
@monzurmorshed.
@monzurmorshed. 4 жыл бұрын
Thank you.
@haoyangzhang6938
@haoyangzhang6938 6 жыл бұрын
what is gradient?
@hanhnguyen84
@hanhnguyen84 7 жыл бұрын
Hi Dr. Knights, Thank you so much for your video! It is very helpful. I am wondering if you could provide me with the link to all the command lines in your lectures. Thanks! Hanh
@BhabaniMishra-t4m
@BhabaniMishra-t4m 2 ай бұрын
Where can I get these codes
@cabrahamg
@cabrahamg 4 жыл бұрын
Does any one has the web page with the pipeline ? Thanks !
Microbiome Discovery 10: Statistical testing part 1
33:53
Dan Knights
Рет қаралды 24 М.
Microbiome Discovery 8: Beta Diversity
19:25
Dan Knights
Рет қаралды 57 М.
Что-что Мурсдей говорит? 💭 #симбочка #симба #мурсдей
00:19
人是不能做到吗?#火影忍者 #家人  #佐助
00:20
火影忍者一家
Рет қаралды 20 МЛН
Гениальное изобретение из обычного стаканчика!
00:31
Лютая физика | Олимпиадная физика
Рет қаралды 4,8 МЛН
StatQuest: Principal Component Analysis (PCA), Step-by-Step
21:58
StatQuest with Josh Starmer
Рет қаралды 3 МЛН
Microbiome Discovery 3: 16S Variable Regions
17:13
Dan Knights
Рет қаралды 51 М.
Microbiome Discovery 7: Alpha Diversity
16:22
Dan Knights
Рет қаралды 58 М.
Microbiome/Metagenome Analysis Workshop: DADA2
47:44
Brown University
Рет қаралды 32 М.
How to Remember Everything You Read
26:12
Justin Sung
Рет қаралды 2,8 МЛН
StatQuest: MDS and PCoA
8:18
StatQuest with Josh Starmer
Рет қаралды 198 М.
Microbiome Discovery 1: Intro to the Microbiome
9:35
Dan Knights
Рет қаралды 49 М.
Microbiome Discovery 5: Picking OTUs
25:18
Dan Knights
Рет қаралды 36 М.
Beta diversity metrics
36:01
QIIME 2
Рет қаралды 9 М.
Что-что Мурсдей говорит? 💭 #симбочка #симба #мурсдей
00:19