مقدمه في تقنية (RNA-seq) لقياس التعبير الجيني في الخلايا | RNA sequencing | Introduction to rna-seq

ادعم القناه ماديا علي باتريون
/ biology_for_all
او يمكن الدعم علي فودافون كاش من هنا :
01013098814
في الفيديو ده هنتكلم بشكل عام عن تقنيه من اهم التقيات المعتمده علي الجيل التالي من السلسله (NGS) والتي تعمل علي قياس التعبير الجيني في الخلايا هنتناقش في عدة مواضيع :
ما هو التعبير الجيني وكيف يختلف بين الخلايا (Gene expression)
لماذا ندرس تقنية (RNA-seq) وما هي اهميتها للباحثين
خطوات القيام بالتجربيه بالتفصيل :
سلسلة الجينوم
experimental design
RNA isolation
Cdna
Size selection
Sequencing
Fastq File
Fastqc software
quality check
exploratory analysis
Principle component analysis
Hierarchical clustering
MA Plot
bioinformatics شرح, ngs شرح, NGS شرح
Differential expression
over the main ideas behind how it's done and how the data is analyzed
Bioinformatics,NGS,Illumina,Data analysis,NGS Data Analysis,Fast A,Fast Q,FatsQC,alignment,DNA-Seq,DNA Analysis,T-Cell,T-cell reseptor,Genome,Genomics,RNA-seq,ubuntu Linux,linux Bioinformatics,Linux For Bioinformatics,Next Generation Sequencing (NGS) - Data Analysis,Understanding NGS sequencing files,RNA Seq data preprocessing,technology of NGS platforms,raw data and software,Next Generation Sequencing (NGS),Illumina Sequencing by Synthesis,NGS sequancing

[@Leopard0ly]

انت احسن انسان في العالم والله.... ميسي البايوانفورميتيكس ونعمه من الله انك تشرح بالعربي بالمستوى العالي والعميق. نتمنى يوماً ما يكون عندنا عمل مشترك في السنين القادمة.

[@MoAbdalfttah]

الله يكرمك يا حبيبي , ده كرم اخلاقك , شكراً ليك

[@faizahalfuhaid1025]

راااااائع جدااااا حقيقي تعبت لين شفت هذا الفيديو سرح مبسط ومفهووم شكرا جزيلاااااا

[@MoAbdalfttah]

الحمد لله , بالتوفيق

[@aichaaldeeb3007]

اخيرا حدا بحكي عربي بيشرح هيك مواضيع كل الشكر ياريت تكمل 💪

[@MoAbdalfttah]

بالتوفيق إن شاء الله , اتمني يكون مفيد ليكي إن شاء الله في بحثك او ما شابه

[@user-zr9hn4ge3i]

عالمي يا ابن بلدي شرح رائع

[@noorothman3296]

شرح مفهوم جدا هذا دليل عله مدى احترافيتك شكرا جزيلا❤

[@MoAbdalfttah]

شكراً جزيلاً

[@ahmedhashim5783]

شرح راقي، ع فكرة انا طالب ماجستير في احدى الجامعات الأوروبية، لكن هنا البورفيسورس ميوصلوش المعلومات مثل حضرتك. على الرغم من انا دخلت هنا كنت ابحث عن كيفية تحليل ال RNAseq بأستخدام اللينكس، لكن وجدت معلومات مفيدة جدا. جزاك اللة خير

[@MoAbdalfttah]

شكراً جداً لحضرتك اهلاً بيك واتمني تحقق اكبر استفاده من القناه ..

[@Leopard0ly]

حتى انا طالب ماجستير ... اخذت الشرح من هذا الفيديو وشرحته في بريزينتيشن واذهلت الدكاتره وطلبو مني مساعدتهم في اقامة ورش عمل. عمل جبار والله يقوم بيه صديقنا محمد شخصيا بدأ يغير في حياتي ولمساته اصبحت واقع.

[@hichemhachani732]

ماشاء الله عليك دمت ذخرا لهذه الامة و نفعا لها

[@MoAbdalfttah]

الله يكرمك شكراً جزيلاً

[@hichemhachani732]

@@MoAbdalfttah اذا ممكن الايميل

[@uncleeddie5135]

استفدت جدا بجد ربنا يفرح قلبك ويسعدك ويرزقك عشان انت وفرت عليا مجهود كبير اوي

[@MoAbdalfttah]

تسلم يا يارب ربنا يوفقك

[@nadaadel7463]

بشكر حضرتك جدا علي الفيديو الممتع والغني دا ❤❤❤❤عندي تحضير ف الماجستير واستفدت جدا جدا

[@yassinkassim8760]

بصدق الله أكبر عليك جزاكم الله خير

[@MoAbdalfttah]

الله يكرمك شكراً جزيلاً

[@seaquit5832]

ما شاءالله عليك كل كلمات الشكر قليلة بحقك على المجهود الكبير والشرح الرائع ... احسنت

[@zineboumragh812]

شكرا على مجهودك ❤

[@MoAbdalfttah]

شكراً جزيلاً دكتوره

[@kiklly]

بارك الله فيك على مجهودك. ياريت الانتباه للعنوان في أول شريحة Introduction

[@rashamoustafa427]

أكرمك الله وزاد علمك🎉🎉😊

[@user-hn5tm3cf7v]

اللهم بارك ...جزاكم الله خيرا ياريت ڤيديو عن design NGS study and how to calculate sample size in that type of studies...

[@MoAbdalfttah]

شكراً جزيلاً , حاضر هحاول

[@saeedalghamdi4045]

Thank you so so soo much

[@MoAbdalfttah]

الله يكرمك , شكراً جزيلاً

[@farhazain6887]

عظيم جدا جدا ربنا يوفقك استمر

[@mariamsalama1019]

جميل جدا.. حقيقي ربنا يكرمك وفرت عليا مذاكره كتير

[@MoAbdalfttah]

الله يكرمك شكراً جزيلاً

[@ahmedzahran1387]

ربنا يباركلك ويوفقك يارب.. شكرا عالفيديوهات دي

[@MoAbdalfttah]

تسلم يا احمد ربنا يباركلك

[@femail860]

could you please do video for single cell RNA seq

[@mariammohammad3900]

جميل اللهم بارك والاجمل ففديوهاتك إنها تخليك متشوق تكمل مش مملة أبدا جزاك الله كل خير

[@MoAbdalfttah]

الله يكرمك , شكراً جزيلاً

[@rezansweety2107]

ماشالله عليك.. محاضره رائعه ومجهود رائع جدا

[@MoAbdalfttah]

شكراً جزيلاً

[@ahmedhashim5783]

كبير يحمادة... ربنا يجعلها بحسناتك

[@MoAbdalfttah]

تسلم ربنا يخليك

[@ektimalsalem9029]

بارك الله لك في علمك لو سمحت شرح على الكشف عن فايروس كورونا باستخدام pcr

[@MoAbdalfttah]

الله يبارك فيك شكراً جداً ان شاء الله هحاول نعمله الفتره الجايه

[@maryamnasser7280]

Thank u ♥️

[@MoAbdalfttah]

You are welcome

[@dan-2637]

يعطيك الف عااااااافيه مره افدتتتتتني

[@MoAbdalfttah]

بالتوفيق ويشرفنا اشتراكك في القناه ..

[@alzahraamortada8968]

جزاك الله خيرا على الفيديو ممكن شرح للميكرو اراى داتا

[@MoAbdalfttah]

الله يكرمك شكراً جزيلاً حاضر

[@alzahraamortada8968]

@@MoAbdalfttah ممكن اعرف اجيب من فين معلومات عن DNA binding motif مفيش هنا على القناة حاولت على يوتيوب ملقتش إفادة كبيرة

[@nesreenhamo7842]

الشرح رائع

[@MoAbdalfttah]

الله يكرمك شكراً جزيلاً

[@mohamedbadrmath3841]

موفق ان شاء الله

[@MoAbdalfttah]

بإذن الله اتمني تكون استفدت

[@hussien7058]

شكرا استاذ على هذا الشرح الوافي ممكن اعرف اين تكمله السلسلة

[@MoAbdalfttah]

السلسله كامله موجوده هنا kzbin.info/www/bejne/jnLchZWnr9J4lc0

[@gggv7312]

ربي يوفقك دكتور ممكن مخاظرات ع البايولوجي جزيئي

[@MoAbdalfttah]

سلام عليكم ممكن تشوفي دول kzbin.info/www/bejne/sJbdhJJsi7V-m5o kzbin.info/www/bejne/ipDJp4F3ipl3h9U

[@yahyaalnaggar8331]

Very interesting

[@MoAbdalfttah]

شكراً اتمني تكون استفدت

[@rezansweety2107]

هل الmRNA اللي عملنا له سكونسك يحوي فقط الجينات المشفره للبروتينات ام يحتوي كل الجينات coding+ non-coding

[@MoAbdalfttah]

الـ mRNA يعبر عن الجينات المشفره للبروتينات , الجينات الغير مشفره للبروتينات تُنتج انواع اخري من الـ RNA ليس منهم mRNA

[@ehabhussein2512]

What is the difference between MA plot and volcano plot?

[@MoAbdalfttah]

I think we explained in the vdio

[@bassimabassma6310]

نحنا بناخد كل mrna لي في الخلية و نحولو لdna و هيك بيكون عندنا عدد كبير و متنوع من fragments لهيك بنحصل على عدد كبير من reads يعني مش بناخد فق mrna واحد for measuring the expression

[@MoAbdalfttah]

مفهمتش الكومنت بتاعك لتداخل اللغه العربيه مع الانجليزيه , لو تقدر تكتب كومنت باللغه الانجليزيه فقط اكون شاكر ليك

[@zeinabezz1426]

مجهود رائع... شكرا جزيلا بس كان عندي استفسار،،، ال differential expression بنستخدمه علشان نطلع الجينات ألي ممكن تعبرلي عن مرض لكن احنا بنعمل clustering لايه بالظبط؟

[@ehabhussein2512]

Volcano plot محتاج شرح ليه

[@MoAbdalfttah]

للاسف مش موجود علي القناه , بس ممكن تشوف في اي قناه تانيه وغالباً بالانجليزي

[@gggv7312]

الله يوفقك ممكن شرح طريقه معرفه الجيين بعد عمل pcr لتحديد مرض معين

[@MoAbdalfttah]

ويوفقك يارب, مش موجود عندي هذا الشرح والله

[@tahafathi288]

السلام عليكم.. سؤال لو تكرمت طب ليه مش فصلنا ال DNA واشتغلنا عليه ووفرنا وقت استخلاص ال RNA وتحويله ل cDNA ⁉️

[@MoAbdalfttah]

عشان انا عايز اشوف التعبير الجيني

[@ayaqz3144]

اري اعرف تعطي كورسات عن ال bioinformatic

[@MoAbdalfttah]

مش فاهم

[@ayaqz3144]

يعني ممكن تسوي كروب تعلمهم بايوانفورمتك على اي تطبيق مقابل اي مبلغ مش مشكله ، انا اختصاص هندسة وراثية وعندي اساسيات انفورمتك بس اريد اتعلمها على NCBI افضل من كتب ?

[@MoAbdalfttah]

انا مش فاهم , ابعتيلي هنا ع الفيس وإن شاء الله اساعدك facebook.com/mohamed.abotreka.547

[@yasminehezema4078]

هل لازم نعمل fragments من mRNA ؟ هو المفروض ان mRNA كل جين مستقل مش زي DNA ال sequence بيكون متصل... ولا حضرتك تقصد ان fragments ب size معين على حسب نوع platform اللي هتستخدم لعمل الsequencing ازاي بنعمل fragments هل باستخدام restricting enzymes ولا فيه kits مخصوصة له

[@MoAbdalfttah]

كل حاجه في البروتوكول ليها Kits مخصوصه , واكيد طبعاً بنعمل قطع من الـ mRNA