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遺伝子発現、アイソフォーム、RNAメチル化など、RNAの多様性を正確に捉えることは、疾患の分子機構やRNA修飾の機能的役割の解明に役立ちます。
従来のショートリードシークエンス技術では、通常50~100bpのリードが生成されるため、トランスクリプトアイソフォームの正確なアセンブリと定量が難しく、poly-A-tail長の測定も困難でした。さらに、これらのライブラリの調製に使用する逆転写と増幅の段階は、RNA修飾を消去し、PCRバイアスをもたらす可能性があります。
ナノポアシークエンスは、native RNAトランスクリプトを直接読み取る唯一の技術であり、PCRバイアスが生じることなく遺伝子とアイソフォームの発現を定量化することができます。また、完全長アイソフォームを解析し、poly-A-tail長を正確に推定することができます。さらに、ダイレクトRNAナノポアシークエンスにより、追加のサンプルを調製することなく、1塩基レベルでDRACHモチーフのm6Aメチル化を直接検出することができます。