BioMart: How to convert Gene symbols into gene IDs

  Рет қаралды 3,646

Dr. Asif's Mol. Biology

Dr. Asif's Mol. Biology

Күн бұрын

Пікірлер: 20
@ibramkhan4576
@ibramkhan4576 2 жыл бұрын
Thanks for sharing useful information.
@shitaldesai4691
@shitaldesai4691 6 ай бұрын
Thank you so much for the detailed video... plz suggest how to convert the gene id to gene names?
@asifmolbio
@asifmolbio 6 ай бұрын
For which specie
@shitaldesai4691
@shitaldesai4691 6 ай бұрын
@@asifmolbio sir, Oryza sativa indica variety ...I want to know the gene names and locus..plz guide how to do this.
@asifmolbio
@asifmolbio 6 ай бұрын
@@shitaldesai4691 www.ricedata.cn
@nwislamicschool
@nwislamicschool Жыл бұрын
Thanks for another great, simple step-by-step video. I am getting numerous result for one gene name. How to choose the right one
@asifmolbio
@asifmolbio Жыл бұрын
Probably there would of many isoforms of one gene. Not many genes
@SarahEslami
@SarahEslami 9 ай бұрын
I need information about Medicago truncatula which is not listed in this website. Please introduce other sites that is listed the organism.
@asifmolbio
@asifmolbio 8 ай бұрын
Sure soon
@samkhan7536
@samkhan7536 2 жыл бұрын
thanks for sharing with us
@asifmolbio
@asifmolbio 2 жыл бұрын
Glad you like it
@AW12
@AW12 Жыл бұрын
what about for organisms not listed here? eg Sesamum indicum
@asifmolbio
@asifmolbio Жыл бұрын
For those we need to do any other method.
@pakchinalover
@pakchinalover 11 ай бұрын
I am having a problem, I uploaded pig Ensemble ID to get gene name and stable ID, phenotype description. But when I pressed on results, it didn't give me the result. 😢
@asifmolbio
@asifmolbio 11 ай бұрын
I think pig 🐖 is not in the list
@pakchinalover
@pakchinalover 11 ай бұрын
@@asifmolbio It's there in the dataset, I selected but no result
@asifmolbio
@asifmolbio 11 ай бұрын
@@pakchinalover intially try with different format and only two to three genes, i never tried it for pig IDs
@pakchinalover
@pakchinalover 11 ай бұрын
@@asifmolbio Ok, Dr sb
@Myri912
@Myri912 Жыл бұрын
But your results is ENSG-Gene not GENE-ID...
@asifmolbio
@asifmolbio Жыл бұрын
Yes right just agree
How to analyze public RNA-seq datasets using iDEP tool
12:57
Dr. Asif's Mol. Biology
Рет қаралды 2,4 М.
3 ways to convert Ensembl IDs to gene symbols | Bioinformatics 101
20:25
Bioinformagician
Рет қаралды 24 М.
МЕНЯ УКУСИЛ ПАУК #shorts
00:23
Паша Осадчий
Рет қаралды 3,6 МЛН
Motorbike Smashes Into Porsche! 😱
00:15
Caters Clips
Рет қаралды 23 МЛН
Overview of gProfiler Tools for Bioinformatics/Biological Analysis
17:28
How to convert gene IDs
3:25
UVABioInfo
Рет қаралды 14 М.
GO terms
34:18
mike vandewege
Рет қаралды 7 М.
An Introduction to BioMart
6:58
Ensembl Training
Рет қаралды 24 М.
How to respond to reviewers' comments
8:18
Elsevier Researcher Academy
Рет қаралды 67
How to select sequences by function and create ID lists with Blast2GO
5:55
BioBam Bioinformatics
Рет қаралды 2 М.
МЕНЯ УКУСИЛ ПАУК #shorts
00:23
Паша Осадчий
Рет қаралды 3,6 МЛН