How to use Molecular evolutionary Genetic Analysis (MEGA) software

  Рет қаралды 138,709

Genomics Lab

Genomics Lab

Күн бұрын

Sophisticated and user-friendly software suite for analyzing DNA and protein sequence data from species and populations.
MEGA can be used with either a graphical user interface (useful for visual exploration of data and results) or a command-line interface (useful for batch or scripted execution). The graphical user interface (GUI) is run in one of two modes. The first mode is the Analyze mode in which all GUI tools in MEGA are enabled and visual results explorers are available for tasks such as editing sequence alignments and viewing phylogenies. This is the mode that most MEGA users are familiar with. The second mode is the Prototype mode which is used solely for generating MEGA Analysis Options (.mao) files that specify analysis settings when using MEGA from a command shell
The command-line interface of MEGA is accessed by opening a command shell and executing the megacc command. The megacc command requires several options, including the path to a .mao file and paths to input data file(s) to be analyzed

Пікірлер: 92
@wongyuzhenkm-pelajar6933
@wongyuzhenkm-pelajar6933 Жыл бұрын
Your tutorial is far more details than my lecturer did!! Thank you so much bruhhhh, U DESERVE THE LIKESSSSSSSS
@manishgsrivastava
@manishgsrivastava 4 жыл бұрын
Good effort.....NJ method is distance based.....not character based....It happens during delivery of lecture sometimes........good effort and keep it up
@priyankat133
@priyankat133 4 жыл бұрын
It is Very much helpful to learn this software.... good explanation👍
@dilipsathyamurthy4014
@dilipsathyamurthy4014 4 жыл бұрын
Its very useful for the unknowing person to learn about the software .. Nice explanation
@takwawannassi2649
@takwawannassi2649 4 жыл бұрын
i have a sequences for a same species i want to know is there variation between sequences, or any difference , and how much , can you help me how i can do that
@rohanmalik2910
@rohanmalik2910 4 жыл бұрын
before constructing a tree, you must align the sequences (preferably by using MUSCLE), is it correct?
@feedi_status7574
@feedi_status7574 3 жыл бұрын
Yes
@sakthikumaran7443
@sakthikumaran7443 6 жыл бұрын
Super bro
@esragbilir
@esragbilir 3 жыл бұрын
Thank you for perfectly showing how to Building Phylogenetic Tree via MEGA
@nazirahmed3715
@nazirahmed3715 4 жыл бұрын
thank you sir i learnt from your lecture how to make phylogenetic tree
@sugumariammal9509
@sugumariammal9509 5 жыл бұрын
Nice
@akkashu6663
@akkashu6663 6 жыл бұрын
Sema da..Nanba..
@wanderingfish
@wanderingfish 2 жыл бұрын
Thank you for this video. This greatly helped us who are starting to learn about MEGA.
@spkspk1416
@spkspk1416 6 жыл бұрын
My god thank u so much... Why don't our teachers teach us like this... They are like change the file extension and what not.
@villageguytamil
@villageguytamil 5 жыл бұрын
Tq
@kishan829
@kishan829 5 жыл бұрын
good explanation
@rajeswaria3374
@rajeswaria3374 6 жыл бұрын
very useful
@lalithaank3287
@lalithaank3287 6 жыл бұрын
nyc and clear
@sanjayraja521
@sanjayraja521 6 жыл бұрын
Super da Maran
@leticiaalcaraz9985
@leticiaalcaraz9985 3 жыл бұрын
Thank you for this tutorial, but it seems that you forgot to align the secuences, you just saved it without align it via ClutalW or MUSCLE. Correct me if I am wrong.
@ajax93full
@ajax93full 3 жыл бұрын
i want to know it too...
@aathirait3600
@aathirait3600 6 жыл бұрын
Simple and clear💡
@ankitarathod2917
@ankitarathod2917 2 жыл бұрын
Thank u for this video
@raymondyoung8473
@raymondyoung8473 2 жыл бұрын
Thnaks so much, a little suggestions: could u add the subtitle, it would be much helpful!
@Ajithkumar-ov2kt
@Ajithkumar-ov2kt 6 жыл бұрын
Nice daa
@ankitarathod2917
@ankitarathod2917 2 жыл бұрын
Plz give me the link for mega software for this version
@jagadeeshwarks01
@jagadeeshwarks01 6 жыл бұрын
Fantastic work and innovative
@deivanaisivagami9969
@deivanaisivagami9969 6 жыл бұрын
very innovative and informative .It will be useful for students easy to understand
@twilight3037
@twilight3037 2 жыл бұрын
Thank you !!!
@pavithrac539
@pavithrac539 5 жыл бұрын
nice explanation
@octagirl
@octagirl 3 жыл бұрын
THANK you sir
@abinaya5011
@abinaya5011 3 жыл бұрын
Thank you for this great video
@mskrithika.tmicrobiology375
@mskrithika.tmicrobiology375 4 жыл бұрын
Thank you. Very clear explanation.
@waqarhussain7671
@waqarhussain7671 4 жыл бұрын
Thank you bro
@kathleenashbaker1177
@kathleenashbaker1177 5 жыл бұрын
Question, is there a way to set the program so that it can run overnight without crashing or going to sleep? (I set my PC up so that it never sleeps).
@endhiranelango2436
@endhiranelango2436 6 жыл бұрын
First time u making the video super U make next video successfully......
@villageguytamil
@villageguytamil 6 жыл бұрын
Sure👍
@arunKumar-pe5fi
@arunKumar-pe5fi 6 жыл бұрын
Good presentation
@villageguytamil
@villageguytamil 6 жыл бұрын
arun Kumar Nandri
@manisudharsan649
@manisudharsan649 5 жыл бұрын
Good work.. Keep going🚶
@dhananjaimp9036
@dhananjaimp9036 3 жыл бұрын
Thanks for doing such an informative video on MEGA. I have a small doubt. In the video you said that Neighbour joining comes under character based method, but I thing it's coming under distance based method. Please correct me if I am wrong. Once again, thank you for the good work. Keep going bro.
@vasudevrjoshi8157
@vasudevrjoshi8157 Жыл бұрын
I think you're right.
@smartsalim4458
@smartsalim4458 6 жыл бұрын
Superrr....
@subashnivesh2851
@subashnivesh2851 6 жыл бұрын
Nice all the Best go next level bro
@arulmozhielamurugu5935
@arulmozhielamurugu5935 6 жыл бұрын
Super...
@jehanalbrahim873
@jehanalbrahim873 2 жыл бұрын
ممتاز
@hemlata2780
@hemlata2780 2 жыл бұрын
Thanks a lot sir for this video 🙏🙏
@kayvee1654
@kayvee1654 6 жыл бұрын
Nice representation
@villageguytamil
@villageguytamil 6 жыл бұрын
🙏
@santhiyaaravind9564
@santhiyaaravind9564 6 жыл бұрын
nizzz and useful
@abhaykashyap2005
@abhaykashyap2005 5 жыл бұрын
Thanq sooo much for making this video it really helpfull thanq 😘
@villageguytamil
@villageguytamil 5 жыл бұрын
Tq😇
@nandhukumar5601
@nandhukumar5601 6 жыл бұрын
Nice da
@villageguytamil
@villageguytamil 6 жыл бұрын
Tq
@aneelanosheen6483
@aneelanosheen6483 3 жыл бұрын
Good job sir keep it up..
@akcreationsak21
@akcreationsak21 6 жыл бұрын
Keet it...up....
@villageguytamil
@villageguytamil 6 жыл бұрын
The anand
@natarajana7440
@natarajana7440 3 жыл бұрын
useful one
@nandhinivetrivel9307
@nandhinivetrivel9307 6 жыл бұрын
Innovative idea ... Keep it up Mara...
@villageguytamil
@villageguytamil 6 жыл бұрын
Thanx ka
@beatriceatieno4243
@beatriceatieno4243 5 жыл бұрын
This video is very helpful. I have come up with a tree using MEGA X but I am having difficulties explaining it. Can I find anybody here who is an expert and is ready to help?
@vigneshm7307
@vigneshm7307 6 жыл бұрын
Sooperda thalaivamaran
@Ashokkumar-gh9mg
@Ashokkumar-gh9mg 6 жыл бұрын
Maran.... 🙌
@HarpreetSingh-ds2zo
@HarpreetSingh-ds2zo 3 жыл бұрын
Thanks broo
@bigode9743
@bigode9743 4 жыл бұрын
Thank you very much
@utkuduran35
@utkuduran35 4 жыл бұрын
thank you bro this is really ubuntu
@rajatranjan974
@rajatranjan974 3 жыл бұрын
Sir, I am aligning sequencing in MEGA format, but after opening the same file, I am getting message "Align Sequences must be of equal length". How to fix this problem?
@heythere2285
@heythere2285 6 жыл бұрын
Watch this for better understanding!! Hail Tamilmaran 🙌🏻
@abhijithk09
@abhijithk09 6 жыл бұрын
Goodd job and keep going on......
@usme-biologo6372
@usme-biologo6372 4 жыл бұрын
un capo el boludo este ,gracias muy buen video me ayudo mucho
@rehanakhan7362
@rehanakhan7362 3 жыл бұрын
😍
@hariharanm4735
@hariharanm4735 6 жыл бұрын
mass da... 😊
@abdichakib4987
@abdichakib4987 2 жыл бұрын
thanks you saved my life from my sister
@ayushikimothi8858
@ayushikimothi8858 Жыл бұрын
Can you tell a way to make a rooted phylogenetic tree? How to choose the out rooted strain?
@raysalevy9281
@raysalevy9281 3 жыл бұрын
could you tell us the names of the sequences you used?
@mahilaayyasamy7304
@mahilaayyasamy7304 6 жыл бұрын
nice ,keep it up, good luck
@villageguytamil
@villageguytamil 6 жыл бұрын
Thanx ka
@theing1233
@theing1233 3 жыл бұрын
thank you ! may be you could make a video for megax cc. I don't konw how to automation.
@GenomicsLab
@GenomicsLab 3 жыл бұрын
Noted
@goodvideo9886
@goodvideo9886 3 жыл бұрын
Please upload the sequence files for practice.
@ahusainsyed3492
@ahusainsyed3492 4 жыл бұрын
Hi can any one help me with a phylogenetic tree. I have 12 isolates which were submitted to the genbank and i have received the accesion number now how do i go about contructing a tree
@tamilselvankannan3857
@tamilselvankannan3857 6 жыл бұрын
Nice try..keep going 😎
@tamanna0095
@tamanna0095 2 жыл бұрын
How i can add this as reference? Any one can help?
@physicsworld7218
@physicsworld7218 9 ай бұрын
Who can use this?
@فاتنحسان-ض7د
@فاتنحسان-ض7د 4 жыл бұрын
can you help me to draw tree please
@dhivyabharathi5
@dhivyabharathi5 4 жыл бұрын
if any one can help me to do ram analysis in mega software
@anandha12
@anandha12 Жыл бұрын
Dude, you completely skipped the alignment altogether!!! People please don't follow this video.
@tsukihimehina8751
@tsukihimehina8751 11 ай бұрын
Wut
@subashnivesh2851
@subashnivesh2851 6 жыл бұрын
Super bro
@Mufa-123
@Mufa-123 6 жыл бұрын
Nice
@aravinthvelusamy5634
@aravinthvelusamy5634 6 жыл бұрын
Super bro
@villageguytamil
@villageguytamil 6 жыл бұрын
Aravinth Velusamy thnx bro
Making a Multiple Sequence Alignment in MEGA
38:10
Janecka Genomics
Рет қаралды 78 М.
Who’s the Real Dad Doll Squid? Can You Guess in 60 Seconds? | Roblox 3D
00:34
How do Cats Eat Watermelon? 🍉
00:21
One More
Рет қаралды 13 МЛН
Крутой фокус + секрет! #shorts
00:10
Роман Magic
Рет қаралды 36 МЛН
How to perform Phylogenetic analysis using MEGA 11 software
13:39
Dr. Asif's Mol. Biology
Рет қаралды 3 М.
Phylogenetic analysis for beginners using MEGA 11 software
11:19
Biology Lectures
Рет қаралды 143 М.
MEGA X: How to construct a phylogenetic tree
7:00
Amer Al-Jawabreh
Рет қаралды 83 М.
FILOGENIA - Alineación (MEGA-X)(BioEdit)(SeaView)(ClustalX)
12:50
Felipe Zuñe
Рет қаралды 36 М.
Multiple Sequence Alignment
9:49
Bob Lessick
Рет қаралды 171 М.
Making a Phylogenetic Tree with Bootstrap Support Values in MEGA
18:13
Janecka Genomics
Рет қаралды 34 М.
How to make phylogenetic tree using mega 11 or Mega XI | Mega software
13:18
MEGA X: Choosing and Acquiring Sequences Part 1
34:41
BH MEGA
Рет қаралды 19 М.
Aprendiendo a usar MEGA - 1
14:07
Tópicos Nucleicos
Рет қаралды 4,1 М.
Pairwise distance
3:17
Evolutionary Genomics
Рет қаралды 4,3 М.
Who’s the Real Dad Doll Squid? Can You Guess in 60 Seconds? | Roblox 3D
00:34