【陈巍学基因】 视频3：Pacific Biosciences Sequencing

[@fionar123]

当成连续剧追了，花一周的睡觉前时间追完这个playlist 😂

[@zhq8682]

陈老师，您讲的很好，但是您能换个背景不，总看一个窗帘有点审美疲劳啊

[@shujunhuang2865]

ZH Q 😄

[@doge-coin]

陳老師您好，想請問一下為什麼一般的定序方式無法測到有經過修飾的鹼基呢？那為什麼PacBio又可以呢？ 這裡聽不是很明白。謝謝！

[@choumagen947]

Nanopore 现在才是最长吧, 1.3 Mb 比PacBio 3万 bp要长的多。 单碱基价格测序也便宜的多

[@ethanlin3024]

老师讲的很好

[@肥羊-y9d]

pacbio算是第三代测序了吧？

[@davidchen4753]

+sheng juan PacBio是第三代测序。

[@肥羊-y9d]

正确率为何只有87.5%啊？

[@davidchen4753]

+sheng juan 根本原因是，Pacific Biosciences的机器，无法直接判断一段时间的同一颜色的荧光，是一个碱基加上去了，还是相连的两个相同的碱基加上去了。为此，只能设一个时间限定，短于这个时间，算一个碱基；长于这个时间限定，算二个碱基；再长，算三个碱基。而一个碱基发出荧光的时间的长度，是一个类似半衰曲线的分布。所以，时间限定的选择，是一个折中的、妥协的选择，87.5%是一个优化点，时间限制设短了，有更多的插入错误，时间限制设长了，有更多的缺失错误。

[@肥羊-y9d]

+David Chen 那这样的话，可以配合illumina一起，或者多做几次，反正速度快哈。

[@davidchen4753]

+sheng juan 是的。在实践操作中，许多做De Novo工作的生物信息公司是用PacBio来得到长的框架，用Illumina来校正碱基。

[@肥羊-y9d]

+David Chen 多谢，陈老师加油！